RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
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RABGEF1-203ENST00000439720 CEP112Q8N8E3 955 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-203ENST00000439720 HSD3B7Q9H2F3 369 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-203ENST00000439720 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-203ENST00000439720 DLEC1Q9Y238 1755 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-203ENST00000439720 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-203ENST00000439720 RDXP35241 583 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
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RABGEF1-203ENST00000439720 ATP2B2Q01814 1243 aa9.54□□□□□ -0.88
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RABGEF1-203ENST00000439720 SSH3Q8TE77 659 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-203ENST00000439720 FAXDC2Q96IV6 333 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-203ENST00000439720 CABS1Q96KC9 395 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-203ENST00000439720 TSPAN18Q96SJ8 248 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-203ENST00000439720 KAT14Q9H8E8 782 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-203ENST00000439720 CDC23Q9UJX2 597 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHA7Q9UN72 937 aa9.54□□□□□ -0.88
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RABGEF1-203ENST00000439720 C21orf2O43822 256 aa9.53□□□□□ -0.88
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RABGEF1-203ENST00000439720 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
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RABGEF1-203ENST00000439720 DCAF5Q96JK2 942 aa9.53□□□□□ -0.88
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RABGEF1-203ENST00000439720 STK31Q9BXU1 1019 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-203ENST00000439720 GBP3Q9H0R5 595 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-203ENST00000439720 FANCLQ9NW38 375 aa9.53□□□□□ -0.88
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RABGEF1-203ENST00000439720 FLIIQ13045 1269 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-203ENST00000439720 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa9.53□□□□□ -0.88
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RABGEF1-203ENST00000439720 PIK3R5Q8WYR1 880 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP4K1Q92918 833 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-203ENST00000439720 USP44Q9H0E7 712 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-203ENST00000439720 NLRP2Q9NX02 1062 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP9.53□□□□□ -0.88
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RABGEF1-203ENST00000439720 MYH15Q9Y2K3 1946 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGEF1-203ENST00000439720 NF2P35240 595 aa9.52□□□□□ -0.88
RABGEF1-203ENST00000439720 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
RABGEF1-203ENST00000439720 BCAS4Q8TDM0 211 aa9.52□□□□□ -0.88
RABGEF1-203ENST00000439720 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
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RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
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RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF569Q5MCW4 686 aa9.52□□□□□ -0.89
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RABGEF1-203ENST00000439720 CTAGE4Q8IX94 777 aa9.51□□□□□ -0.89
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RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF202O95125 648 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC175P0C221 793 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-203ENST00000439720 MYL5Q02045 173 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-203ENST00000439720 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-203ENST00000439720 ADALQ6DHV7 355 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-203ENST00000439720 JMYQ8N9B5 988 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM76AQ8TAV0 307 aa9.5□□□□□ -0.89
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