RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439248.5

TTLL1-203, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL1, Length 1,659 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1-203ENST00000439248 PTPREP23469 700 aa16.35■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 MAP3K12Q12852 859 aa16.35■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 SART3Q15020 963 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 PARP10Q53GL7 1025 aa16.35■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 TMEM67Q5HYA8 995 aa16.35■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 NOSTRINQ8IVI9 506 aa16.35■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 TRIM22Q8IYM9 498 aa16.35■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 CNNM3Q8NE01 707 aa16.35■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 SLC12A7Q9Y666 1083 aa16.35■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 STX10O60499 249 aa16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 SERPINC1P01008 464 aa16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 MMP1P03956 469 aa16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 TOP1P11387 765 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 GYS1P13807 737 aa16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 CDC27P30260 824 aa16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 SARSP49591 514 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 STAG1Q8WVM7 1258 aa16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 AIDAQ96BJ3 306 aa16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 ARID3AQ99856 593 aa16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 DNAI1Q9UI46 699 aa16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 RTL9Q8NET4 1388 aa16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 BIN1O00499 593 aa16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 RGL2O15211 777 aa16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 DEXIO95424 95 aa16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 NTSR2O95665 410 aa16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 BMP15O95972 392 aa16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 AKNAD1Q5T1N1 836 aa16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 NFXL1Q6ZNB6 911 aa16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 NACAP1Q9BZK3 213 aa16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 GREM2Q9H772 168 aa16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 PRDM10Q9NQV6 1147 aa16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-203ENST00000439248 A0A087WWV3 80 aa16.33■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 B4E1Z4 1266 aa16.33■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 SLC5A1P13866 664 aa16.33■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 ZNF18P17022 549 aa16.33■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 TUBB4BP68371 445 aa16.33■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa16.33■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 SYT10Q6XYQ8 523 aa16.33■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 IFNL3Q8IZI9 196 aa16.33■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 SETDB2Q96T68 719 aa16.33■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 NAPBQ9H115 298 aa16.33■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 EFCAB8A8MWE9 144 aa16.32■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 IDH1O75874 414 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 APPP05067 770 aa16.32■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 NFIXQ14938 502 aa16.32■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 ELF2Q15723 593 aa16.32■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 CFAP100Q494V2 611 aa16.32■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 TRIM65Q6PJ69 517 aa16.32■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 REXO1L1PQ8IX06 675 aa16.32■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 SPATA20Q8TB22 786 aa16.32■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa16.32■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 TAF1P21675 1872 aa16.32■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 SEMA3EO15041 775 aa16.31■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 PCP11498 1178 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 TUBB2AQ13885 445 aa16.31■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 MORC3Q14149 939 aa16.31■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 LONRF3Q496Y0 759 aa16.31■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 HOMER1Q86YM7 354 aa16.31■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 FLAD1Q8NFF5 587 aa16.31■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 TUBB2BQ9BVA1 445 aa16.31■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 PNOCQ13519 176 aa16.3■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 POSTNQ15063 836 aa16.3■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 PI16Q6UXB8 463 aa16.3■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 MFSD6Q6ZSS7 791 aa16.3■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 MICU3Q86XE3 530 aa16.3■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 SPATA5Q8NB90 893 aa16.3■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 GJB4Q9NTQ9 266 aa16.3■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 ZSWIM5Q9P217 1185 aa16.3■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 ERICH2A1L162 156 aa16.3■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 PPFIA3O75145 1194 aa16.3■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 SLFN14P0C7P3 912 aa16.3■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 ATP1A3P13637 1013 aa16.3■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 PHKA1P46020 1223 aa16.3■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 RTN1Q16799 776 aa16.3■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 ERFEQ4G0M1 354 aa16.3■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa16.3■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 TMEM139Q8IV31 216 aa16.3■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 STK11IPQ8N1F8 1099 aa16.3■□□□□ 0.2
TTLL1-203ENST00000439248 CCDC24Q8N4L8 307 aa16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms