RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 F13A1P00488 732 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF792Q3KQV3 632 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 LETMD1Q6P1Q0 360 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 CDH24Q86UP0 819 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 KCT2Q8NC54 265 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 FBXO27Q8NI29 283 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 HRASLS5Q96KN8 279 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-208ENST00000427110 TMEM265A0A087WTH1 108 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 GNAT3A8MTJ3 354 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 UPK3BL1B0FP48 263 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 UPK3BL2E5RIL1 263 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 TLR3O15455 904 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 GRIN3BO60391 1043 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 PRKCQQ04759 706 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 IKZF1Q13422 519 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 CDKAL1Q5VV42 579 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 CBLL1Q75N03 491 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 STK11IPQ8N1F8 1099 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 AGBL5Q8NDL9 886 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 TMEM87BQ96K49 555 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 RHOVQ96L33 236 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 TMEM74Q96NL1 305 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 KBTBD4Q9NVX7 518 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 FAM221AA4D161 298 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 H3BS24 57 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 CST3P01034 146 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 PLCG1P19174 1290 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 FUT4P22083 530 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 LMNB2Q03252 620 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 SNAP47Q5SQN1 464 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 SFRP5Q5T4F7 317 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 RELL1Q8IUW5 271 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 GOLM1Q8NBJ4 401 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 TMEM87AQ8NBN3 555 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 LRRN4CLQ8ND94 238 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 MISP3Q96FF7 219 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 HSPA12BQ96MM6 686 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 TNKS2Q9H2K2 1166 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 MKNK2Q9HBH9 465 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 ATP13A1Q9HD20 1204 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 VAV3Q9UKW4 847 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 RNF114Q9Y508 228 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 WASH4PA8MWX3 477 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 CILPO75339 1184 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 PAPLNO95428 1278 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 BPNT1O95861 308 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 RECKO95980 971 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 RLBP1P12271 317 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 CAP2P40123 477 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 ZP2Q05996 745 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 MFSD4AQ8N468 514 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 MFSD2AQ8NA29 543 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 PI4K2BQ8TCG2 481 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 GATAD2BQ8WXI9 593 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 BACH2Q9BYV9 841 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 KLHL3Q9UH77 587 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 PAX4O43316 350 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 DNAJA2O60884 412 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 ITGB5P18084 799 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 GARTP22102 1010 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 PDE4BQ07343 736 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 FBXL19Q6PCT2 694 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 ERMP1Q7Z2K6 904 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 FAM13CQ8NE31 585 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 DNAJB8Q8NHS0 232 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 RSRP1Q9BUV0 290 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 SEMA3GQ9NS98 782 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 REV1Q9UBZ9 1251 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 GGT7Q9UJ14 662 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 HTR3BO95264 441 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 VAMP1P23763 118 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 CRKP46108 304 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 CLCN7P51798 805 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 TNK2Q07912 1038 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-208ENST00000427110 LDLRAD1Q5T700 205 aa3.98□□□□□ -1.77
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