RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 CATIPQ7Z7H3 387 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP5-204ENST00000412806 PANK2Q9BZ23 570 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP5-204ENST00000412806 KCNQ5Q9NR82 932 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP5-204ENST00000412806 TAOK2Q9UL54 1235 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP5-204ENST00000412806 PODNQ7Z5L7 613 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BP5-204ENST00000412806 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
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SH3BP5-204ENST00000412806 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.07■■□□□ 1.6
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SH3BP5-204ENST00000412806 CALM2P0DP24 149 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP5-204ENST00000412806 CALM3P0DP25 149 aa25.06■■□□□ 1.6
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SH3BP5-204ENST00000412806 C16orf86Q6ZW13 317 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP5-204ENST00000412806 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
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SH3BP5-204ENST00000412806 PLEKHA8P1O95397 391 aa25.04■■□□□ 1.6
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SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SH3BP5-204ENST00000412806 RTEL1Q9NZ71 1219 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP5-204ENST00000412806 C21orf2O43822 256 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP5-204ENST00000412806 CDK8P49336 464 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP5-204ENST00000412806 FUT2Q10981 343 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP5-204ENST00000412806 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
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SH3BP5-204ENST00000412806 USP17L4A6NCW7 530 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP5-204ENST00000412806 TSPY3P0CV98 308 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP5-204ENST00000412806 TSPY8P0CW00 308 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP5-204ENST00000412806 PICALMQ13492 652 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP5-204ENST00000412806 STRIP1Q5VSL9 837 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP5-204ENST00000412806 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP5-204ENST00000412806 HHIPL2Q6UWX4 724 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP5-204ENST00000412806 USP17L1Q7RTZ2 530 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP5-204ENST00000412806 BICD2Q8TD16 824 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP5-204ENST00000412806 CLIC4Q9Y696 253 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP5-204ENST00000412806 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
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SH3BP5-204ENST00000412806 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
SH3BP5-204ENST00000412806 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
SH3BP5-204ENST00000412806 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BP5-204ENST00000412806 TMTC3Q6ZXV5 915 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BP5-204ENST00000412806 ANKS1AQ92625 1134 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BP5-204ENST00000412806 TSPY26PQ9H489 355 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF287Q9HBT7 754 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BP5-204ENST00000412806 USP40Q9NVE5 1235 aa25.01■■□□□ 1.59
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SH3BP5-204ENST00000412806 KAT14Q9H8E8 782 aa25■■□□□ 1.59
SH3BP5-204ENST00000412806 POLR3EQ9NVU0 708 aa25■■□□□ 1.59
SH3BP5-204ENST00000412806 KCNJ14Q9UNX9 436 aa25■■□□□ 1.59
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SH3BP5-204ENST00000412806 PKN1Q16512 942 aa25■■□□□ 1.59
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SH3BP5-204ENST00000412806 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa25■■□□□ 1.59
SH3BP5-204ENST00000412806 LINC00301Q8NCQ3 95 aa25■■□□□ 1.59
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SH3BP5-204ENST00000412806 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP25■■□□□ 1.59
SH3BP5-204ENST00000412806 DACT1Q9NYF0 836 aa25■■□□□ 1.59
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SH3BP5-204ENST00000412806 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.99■■□□□ 1.59
SH3BP5-204ENST00000412806 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa24.98■■□□□ 1.59
SH3BP5-204ENST00000412806 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa24.98■■□□□ 1.59
SH3BP5-204ENST00000412806 DPEP1P16444 411 aa24.98■■□□□ 1.59
SH3BP5-204ENST00000412806 KCNA3P22001 575 aa24.98■■□□□ 1.59
SH3BP5-204ENST00000412806 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SH3BP5-204ENST00000412806 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SH3BP5-204ENST00000412806 NR1I2O75469 434 aa24.98■■□□□ 1.59
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