RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 SKILP12757 684 aa27.38■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 CCZ1BP86790 482 aa27.38■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 NCAPHQ15003 741 aa27.38■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 NBPF11Q86T75 865 aa27.38■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 TNNT1P13805 278 aa27.37■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 PPARAQ07869 468 aa27.37■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 PRKAB2O43741 272 aa27.36■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 SGIP1Q9BQI5 828 aa27.36■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 MTFR1LQ9H019 292 aa27.36■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 SEMA3EO15041 775 aa27.36■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 CYP7A1P22680 504 aa27.36■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 ESR2Q92731 530 aa27.36■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 INCENPQ9NQS7 918 aa27.36■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 TPTE2Q6XPS3 522 aa27.35■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa27.35■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 FANCBQ8NB91 859 aa27.35■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 BRIP1Q9BX63 1249 aa27.35■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa27.34■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 SNAP23O00161 211 aa27.34■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 SLC10A5Q5PT55 438 aa27.34■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 KRBA2Q6ZNG9 492 aa27.34■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 NYAP1Q6ZVC0 841 aa27.34■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 CNBD1Q8NA66 436 aa27.34■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 MYL10Q9BUA6 226 aa27.34■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 KCNH3Q9ULD8 1083 aa27.34■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 CEP131Q9UPN4 1083 aa27.34■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 TUBB4AP04350 444 aa27.34■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 FGRP09769 529 aa27.34■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 PTPREP23469 700 aa27.34■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 SEC23AQ15436 765 aa27.34■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 ZNF654Q8IZM8 581 aa27.34■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 ZNF710Q8N1W2 664 aa27.34■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 UBAC1Q9BSL1 405 aa27.34■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa27.33■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 A0A087WWV3 80 aa27.33■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 CBFA2T2O43439 604 aa27.33■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 IGSF3O75054 1194 aa27.33■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 PTGER2P43116 358 aa27.33■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa27.33■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 NYXQ9GZU5 481 aa27.33■■□□□ 1.97
PMS1-205ENST00000409985 NRDCO43847 1150 aa27.32■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD7Q92527 254 aa27.32■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 PARP3Q9Y6F1 533 aa27.32■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 MYL5Q02045 173 aa27.32■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 CAVIN4Q5BKX8 364 aa27.32■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 COL4A1P02462 1669 aa27.31■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 CACNA1SQ13698 1873 aa27.31■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 IFNKQ9P0W0 207 aa27.31■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 BTBD18B2RXH4 712 aa27.3■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 XBP1P17861 261 aa27.3■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 NT5C2P49902 561 aa27.3■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 NT5DC1Q5TFE4 455 aa27.3■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 CEP135Q66GS9 1140 aa27.3■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 KANK3Q6NY19 840 aa27.3■■□□□ 1.96
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PMS1-205ENST00000409985 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
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PMS1-205ENST00000409985 CALM1P0DP23 149 aa27.3■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 CALM2P0DP24 149 aa27.3■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 CALM3P0DP25 149 aa27.3■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 PTPN14Q15678 1187 aa27.3■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 STK11IPQ8N1F8 1099 aa27.3■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 TOMM22Q9NS69 142 aa27.3■■□□□ 1.96
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PMS1-205ENST00000409985 BIN1O00499 593 aa27.29■■□□□ 1.96
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PMS1-205ENST00000409985 ARID5BQ14865 1188 aa27.29■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 MIGA1Q8NAN2 632 aa27.29■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 DLEC1Q9Y238 1755 aa27.28■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 SMC2O95347 1197 aa27.28■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 GUCY1A2P33402 732 aa27.28■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 LONRF3Q496Y0 759 aa27.28■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 TRIML1Q8N9V2 468 aa27.28■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 CCDC112Q8NEF3 446 aa27.28■■□□□ 1.96
PMS1-205ENST00000409985 DUOX1Q9NRD9 1551 aa27.28■■□□□ 1.96
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