RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
CNN3-202ENST00000394202 IL17RBQ9NRM6 502 aa27.39■■□□□ 1.97
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CNN3-202ENST00000394202 SEC23AQ15436 765 aa27.38■■□□□ 1.97
CNN3-202ENST00000394202 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
CNN3-202ENST00000394202 UBAC1Q9BSL1 405 aa27.38■■□□□ 1.97
CNN3-202ENST00000394202 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
CNN3-202ENST00000394202 TNKSO95271 1327 aa27.38■■□□□ 1.97
CNN3-202ENST00000394202 EVCP57679 992 aa27.37■■□□□ 1.97
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CNN3-202ENST00000394202 IQCA1Q86XH1 822 aa27.36■■□□□ 1.97
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CNN3-202ENST00000394202 TEPSINQ96N21 525 aa27.36■■□□□ 1.97
CNN3-202ENST00000394202 GGA3Q9NZ52 723 aa27.36■■□□□ 1.97
CNN3-202ENST00000394202 SWAP70Q9UH65 585 aa27.36■■□□□ 1.97
CNN3-202ENST00000394202 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
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CNN3-202ENST00000394202 TSPY8P0CW00 308 aa27.35■■□□□ 1.97
CNN3-202ENST00000394202 LIFRP42702 1097 aa27.35■■□□□ 1.97
CNN3-202ENST00000394202 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
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CNN3-202ENST00000394202 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP27.35■■□□□ 1.97
CNN3-202ENST00000394202 DEFB129Q9H1M3 183 aa27.35■■□□□ 1.97
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CNN3-202ENST00000394202 AKR1B1P15121 316 aa27.35■■□□□ 1.97
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CNN3-202ENST00000394202 POTECB2RU33 542 aa27.34■■□□□ 1.97
CNN3-202ENST00000394202 RCSD1Q6JBY9 416 aa27.34■■□□□ 1.97
CNN3-202ENST00000394202 SGMS1Q86VZ5 419 aa27.34■■□□□ 1.97
CNN3-202ENST00000394202 MTA3Q9BTC8 594 aa27.34■■□□□ 1.97
CNN3-202ENST00000394202 HPS5Q9UPZ3 1129 aa27.34■■□□□ 1.97
CNN3-202ENST00000394202 TNNI2P48788 182 aa27.33■■□□□ 1.97
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CNN3-202ENST00000394202 MYL10Q9BUA6 226 aa27.33■■□□□ 1.97
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CNN3-202ENST00000394202 ERICH2A1L162 156 aa27.33■■□□□ 1.97
CNN3-202ENST00000394202 RXRAP19793 462 aa27.33■■□□□ 1.97
CNN3-202ENST00000394202 CCT2P78371 535 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
CNN3-202ENST00000394202 TNFAIP1Q13829 316 aa27.33■■□□□ 1.97
CNN3-202ENST00000394202 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa27.33■■□□□ 1.97
CNN3-202ENST00000394202 TATDN1Q6P1N9 297 aa27.33■■□□□ 1.97
CNN3-202ENST00000394202 NFXL1Q6ZNB6 911 aa27.33■■□□□ 1.97
CNN3-202ENST00000394202 MIGA2Q7L4E1 593 aa27.33■■□□□ 1.97
CNN3-202ENST00000394202 NEDD1Q8NHV4 660 aa27.33■■□□□ 1.97
CNN3-202ENST00000394202 SCRN1Q12765 414 aa27.32■■□□□ 1.96
CNN3-202ENST00000394202 APOA5Q6Q788 366 aa27.32■■□□□ 1.96
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CNN3-202ENST00000394202 EPHX2P34913 555 aa27.31■■□□□ 1.96
CNN3-202ENST00000394202 GTF3C6Q969F1 213 aa27.31■■□□□ 1.96
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CNN3-202ENST00000394202 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP27.31■■□□□ 1.96
CNN3-202ENST00000394202 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa27.31■■□□□ 1.96
CNN3-202ENST00000394202 JAG1P78504 1218 aa27.3■■□□□ 1.96
CNN3-202ENST00000394202 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
CNN3-202ENST00000394202 DLK2Q6UY11 383 aa27.3■■□□□ 1.96
CNN3-202ENST00000394202 CLEC10AQ8IUN9 316 aa27.3■■□□□ 1.96
CNN3-202ENST00000394202 CCDC69A6NI79 296 aa27.29■■□□□ 1.96
CNN3-202ENST00000394202 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
CNN3-202ENST00000394202 CEP95Q96GE4 821 aa27.29■■□□□ 1.96
CNN3-202ENST00000394202 NT5C2P49902 561 aa27.29■■□□□ 1.96
CNN3-202ENST00000394202 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
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CNN3-202ENST00000394202 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
CNN3-202ENST00000394202 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa27.29■■□□□ 1.96
CNN3-202ENST00000394202 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
CNN3-202ENST00000394202 SLC12A7Q9Y666 1083 aa27.29■■□□□ 1.96
CNN3-202ENST00000394202 GDF11O95390 407 aa27.28■■□□□ 1.96
CNN3-202ENST00000394202 TMTC2Q8N394 836 aa27.28■■□□□ 1.96
CNN3-202ENST00000394202 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
CNN3-202ENST00000394202 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
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CNN3-202ENST00000394202 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa27.27■■□□□ 1.96
CNN3-202ENST00000394202 DDIT3P35638 169 aa27.27■■□□□ 1.96
CNN3-202ENST00000394202 MAP3K10Q02779 954 aa27.27■■□□□ 1.96
CNN3-202ENST00000394202 ZNF654Q8IZM8 581 aa27.27■■□□□ 1.96
CNN3-202ENST00000394202 STX8Q9UNK0 236 aa27.27■■□□□ 1.96
CNN3-202ENST00000394202 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
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CNN3-202ENST00000394202 ZBTB43O43298 467 aa27.26■■□□□ 1.95
CNN3-202ENST00000394202 PPFIA3O75145 1194 aa27.26■■□□□ 1.95
CNN3-202ENST00000394202 DGKHQ86XP1 1220 aa27.26■■□□□ 1.95
CNN3-202ENST00000394202 ANKS1AQ92625 1134 aa27.26■■□□□ 1.95
CNN3-202ENST00000394202 PLIN4Q96Q06 1357 aa27.26■■□□□ 1.95
CNN3-202ENST00000394202 TBC1D12O60347 775 aa27.26■■□□□ 1.95
CNN3-202ENST00000394202 CTDNEP1O95476 244 aa27.26■■□□□ 1.95
CNN3-202ENST00000394202 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
CNN3-202ENST00000394202 CCDC17Q96LX7 622 aa27.26■■□□□ 1.95
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