RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 HMGCS2P54868 508 aa24.41■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 TATDN1Q6P1N9 297 aa24.41■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 KBTBD3Q8NAB2 608 aa24.41■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 WDR18Q9BV38 432 aa24.41■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 SOX10P56693 466 aa24.4■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 AAMPQ13685 434 aa24.4■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 TREML2Q5T2D2 321 aa24.4■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKRD45Q5TZF3 282 aa24.4■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
ANKRD39-201ENST00000393537 GH2P01242 217 aa24.39■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 EVX2Q03828 476 aa24.39■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 MTMR2Q13614 643 aa24.39■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 GCC1Q96CN9 775 aa24.39■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 ERC2O15083 957 aa24.38■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP2D6P10635 497 aa24.38■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 SHMT1P34896 483 aa24.38■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 SH3D19Q5HYK7 790 aa24.38■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 PI4K2BQ8TCG2 481 aa24.38■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa24.38■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 BCRP11274 1271 aa24.37■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 MX1P20591 662 aa24.37■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 BACE1P56817 501 aa24.37■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 GABPAQ06546 454 aa24.37■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.37■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 PNMA3Q9UL41 463 aa24.37■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 CTGFP29279 349 aa24.36■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 PSMC4P43686 418 aa24.36■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 RGS19P49795 217 aa24.36■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 ABCB5Q2M3G0 1257 aa24.36■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 TMOD4Q9NZQ9 345 aa24.36■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa24.36■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 MGAMO43451 1857 aa24.36■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 MYH8P13535 1937 aa24.35■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 USP17L10C9JJH3 530 aa24.35■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.35■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa24.35■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 C19orf81C9J6K1 198 aa24.34■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 GNRH1P01148 92 aa24.34■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 RAB3GAP1Q15042 981 aa24.34■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 APPBP2Q92624 585 aa24.34■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.34■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM47Q96LD4 638 aa24.34■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 CABP5Q9NP86 173 aa24.34■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 SALL3Q9BXA9 1300 aa24.34■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 OSBPP22059 807 aa24.33■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC44A5Q8NCS7 719 aa24.33■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 OSBP2Q969R2 916 aa24.33■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 DYNLL2Q96FJ2 89 aa24.33■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa24.32■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 USP17L12C9JPN9 530 aa24.32■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 USP17L21D6R901 530 aa24.32■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 AMOTL1Q8IY63 956 aa24.32■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa24.32■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 FEZ1Q99689 392 aa24.32■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 SWAP70Q9UH65 585 aa24.32■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 C12orf60Q5U649 245 aa24.31■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.31■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 ARMC5Q96C12 935 aa24.31■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 FSD1Q9BTV5 496 aa24.31■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.31■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 SMIM22K7EJ46 135 aa24.3■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 HOXD10P28358 340 aa24.3■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 GUCY1A2P33402 732 aa24.3■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 PRMT2P55345 433 aa24.3■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 FCGRTP55899 365 aa24.3■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.3■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 SRRDQ9UH36 339 aa24.3■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 TAOK2Q9UL54 1235 aa24.3■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 M0R2C6 588 aa24.29■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 SEPT2Q15019 361 aa24.29■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 CTR9Q6PD62 1173 aa24.29■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 SMC5Q8IY18 1101 aa24.29■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 ACER1Q8TDN7 264 aa24.29■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 LNPKQ9C0E8 428 aa24.29■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 STAP2Q9UGK3 403 aa24.29■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 GPAA1O43292 621 aa24.28■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 IGHDP01880 384 aa24.28■■□□□ 1.48
ANKRD39-201ENST00000393537 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms