RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380958.7

PAN3-201, Transcript of poly(A) specific ribonuclease subunit PAN3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PAN3, Length 2,833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3-201ENST00000380958 FANCGO15287 622 aa22.78■■□□□ 1.24
PAN3-201ENST00000380958 RTN1Q16799 776 aa22.78■■□□□ 1.24
PAN3-201ENST00000380958 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.78■■□□□ 1.24
PAN3-201ENST00000380958 KCNJ6P48051 423 aa22.78■■□□□ 1.24
PAN3-201ENST00000380958 LCORLQ8N3X6 602 aa22.78■■□□□ 1.24
PAN3-201ENST00000380958 MNS1Q8NEH6 495 aa22.78■■□□□ 1.24
PAN3-201ENST00000380958 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PAN3-201ENST00000380958 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.77■■□□□ 1.24
PAN3-201ENST00000380958 MMP1P03956 469 aa22.77■■□□□ 1.24
PAN3-201ENST00000380958 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PAN3-201ENST00000380958 ETF1P62495 437 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PAN3-201ENST00000380958 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PAN3-201ENST00000380958 CNNM3Q8NE01 707 aa22.77■■□□□ 1.24
PAN3-201ENST00000380958 UBXN4Q92575 508 aa22.77■■□□□ 1.24
PAN3-201ENST00000380958 CARD6Q9BX69 1037 aa22.77■■□□□ 1.24
PAN3-201ENST00000380958 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PAN3-201ENST00000380958 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.77■■□□□ 1.24
PAN3-201ENST00000380958 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PAN3-201ENST00000380958 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PAN3-201ENST00000380958 MYL5Q02045 173 aa22.77■■□□□ 1.24
PAN3-201ENST00000380958 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PAN3-201ENST00000380958 L2HGDHQ9H9P8 463 aa22.77■■□□□ 1.24
PAN3-201ENST00000380958 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.77■■□□□ 1.24
PAN3-201ENST00000380958 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.77■■□□□ 1.24
PAN3-201ENST00000380958 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.77■■□□□ 1.24
PAN3-201ENST00000380958 DEXIO95424 95 aa22.77■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 BCAMP50895 628 aa22.77■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 CHRNDQ07001 517 aa22.77■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 PDE4BQ07343 736 aa22.77■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.77■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.77■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 RGL2O15211 777 aa22.76■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 OLFM4Q6UX06 510 aa22.76■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.76■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.76■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 TOMM22Q9NS69 142 aa22.76■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 ADKP55263 362 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 GRIN1Q05586 938 aa22.75■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 TULP2O00295 520 aa22.75■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 CCDC93Q567U6 631 aa22.75■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.75■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.74■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 A0A1B0GUL6 1792 aa22.74■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 CBFA2T2O43439 604 aa22.74■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 PPARAQ07869 468 aa22.74■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.74■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.74■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 PRKAB2O43741 272 aa22.73■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 ESR2Q92731 530 aa22.73■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.73■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 SNAP23O00161 211 aa22.73■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 BMP6P22004 513 aa22.73■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 UBE4AQ14139 1066 aa22.73■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.73■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 DESI2Q9BSY9 194 aa22.73■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.73■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.73■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.73■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 ITPK1Q13572 414 aa22.72■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 TRIM65Q6PJ69 517 aa22.72■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 TUBB4AP04350 444 aa22.72■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 CYP7A1P22680 504 aa22.72■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 GUCY1A2P33402 732 aa22.72■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 BTBD18B2RXH4 712 aa22.72■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 GNG11P61952 73 aa22.72■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.72■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 FANCBQ8NB91 859 aa22.72■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.71■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 INTS13Q9NVM9 706 aa22.71■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 PRR29P0C7W0 189 aa22.71■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.71■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 VSTM4Q8IW00 320 aa22.71■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 REXO1L1PQ8IX06 675 aa22.71■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 WDR24Q96S15 920 aa22.71■■□□□ 1.23
PAN3-201ENST00000380958 XBP1P17861 261 aa22.7■■□□□ 1.22
PAN3-201ENST00000380958 PTPREP23469 700 aa22.7■■□□□ 1.22
PAN3-201ENST00000380958 TMCO3Q6UWJ1 677 aa22.7■■□□□ 1.22
PAN3-201ENST00000380958 TEX35Q5T0J7 233 aa22.7■■□□□ 1.22
PAN3-201ENST00000380958 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa22.7■■□□□ 1.22
PAN3-201ENST00000380958 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PAN3-201ENST00000380958 BARGINQ6ZT62 677 aa22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms