RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
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PGGT1B-202ENST00000379615 IFNL3Q8IZI9 196 aa18.38■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 RUFY2Q8WXA3 655 aa18.38■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 DNAJC18Q9H819 358 aa18.38■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 AS3MTQ9HBK9 375 aa18.38■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF287Q9HBT7 754 aa18.38■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNH4Q9UQ05 1017 aa18.38■□□□□ 0.53
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PGGT1B-202ENST00000379615 CYP2D6P10635 497 aa18.37■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 CCL15Q16663 113 aa18.37■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 MS4A4AQ96JQ5 239 aa18.37■□□□□ 0.53
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PGGT1B-202ENST00000379615 MINDY4BA8MYZ0 360 aa18.36■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 SHMT1P34896 483 aa18.36■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 ABCB5Q2M3G0 1257 aa18.36■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC171Q6TFL3 1326 aa18.36■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa18.36■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 IFNL1Q8IU54 200 aa18.36■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC17Q96LX7 622 aa18.36■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 MCOLN1Q9GZU1 580 aa18.36■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF186Q9NXI6 227 aa18.36■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa18.36■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 TRPA1O75762 1119 aa18.35■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 GDF11O95390 407 aa18.35■□□□□ 0.53
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF280CQ8ND82 737 aa18.35■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 WDR18Q9BV38 432 aa18.35■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa18.35■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa18.34■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 GH2P01242 217 aa18.34■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 CDK8P49336 464 aa18.34■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 DGKZQ13574 1117 aa18.34■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 BMP2KLQ5H9B9 411 aa18.34■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 BRI3BPQ8WY22 251 aa18.34■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 DYNLL2Q96FJ2 89 aa18.34■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 MKNK2Q9HBH9 465 aa18.34■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 DOCK1Q14185 1865 aa18.33■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 SIPA1L1O43166 1804 aa18.33■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 RAD50Q92878 1312 aa18.33■□□□□ 0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM75PA6NK02 468 aa18.33■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 SPP2Q13103 211 aa18.33■□□□□ 0.52
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PGGT1B-202ENST00000379615 CHMLP26374 656 aa18.32■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 PDE4BQ07343 736 aa18.32■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 RAB3GAP1Q15042 981 aa18.32■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM179Q6ZVK1 233 aa18.32■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC44A5Q8NCS7 719 aa18.32■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 C19orf81C9J6K1 198 aa18.31■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 USP17L10C9JJH3 530 aa18.31■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP18.31■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 PPARAQ07869 468 aa18.31■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 VPS53Q5VIR6 699 aa18.31■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKRD23Q86SG2 305 aa18.31■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 PTPN18Q99952 460 aa18.31■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 CFHR5Q9BXR6 569 aa18.31■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 TMOD4Q9NZQ9 345 aa18.31■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 CTNNA3Q9UI47 895 aa18.31■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 ROBO3Q96MS0 1386 aa18.3■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 ZMYM6O95789 1325 aa18.3■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 BTBD19C9JJ37 291 aa18.3■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 FGAP02671 866 aa18.3■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 BACE1P56817 501 aa18.3■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 EVX2Q03828 476 aa18.3■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 CASC1Q6TDU7 716 aa18.3■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 GADL1Q6ZQY3 521 aa18.3■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 FEZ1Q99689 392 aa18.3■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa18.3■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 FOXP2O15409 715 aa18.29■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 JAG1P78504 1218 aa18.29■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 DSCC1Q9BVC3 393 aa18.29■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 ANAPC4Q9UJX5 808 aa18.29■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 PDHXO00330 501 aa18.28■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 TBC1D8O95759 1140 aa18.28■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 AKR1B1P15121 316 aa18.28■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 USP14P54578 494 aa18.28■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 HMGCS2P54868 508 aa18.28■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP18.28■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 MTMR2Q13614 643 aa18.28■□□□□ 0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 SEPT2Q15019 361 aa18.28■□□□□ 0.52
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