RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376392.10

NME1-NME2-201, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 894 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-201ENST00000376392 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa15.11■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 FLT1P17948 1338 aa15.11■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 PSME4Q14997 1843 aa15.1■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 KIF13BQ9NQT8 1826 aa15.1■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP15.1■□□□□ 0.011e-7■□□□□ 10
NME1-NME2-201ENST00000376392 CHRNA5P30532 468 aa15.1■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 KIF5BP33176 963 aa15.1■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 TPRNQ4KMQ1 711 aa15.1■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 HHIPL2Q6UWX4 724 aa15.1■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 OLFM4Q6UX06 510 aa15.1■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 GAS2L3Q86XJ1 694 aa15.1■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 DGKHQ86XP1 1220 aa15.1■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 TEKT1Q969V4 418 aa15.1■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 KAT14Q9H8E8 782 aa15.1■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 RTEL1Q9NZ71 1219 aa15.1■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 YEATS4O95619 227 aa15.09■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 TSPY3P0CV98 308 aa15.09■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 TSPY8P0CW00 308 aa15.09■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 RHBDL3P58872 404 aa15.09■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 TFAP4Q01664 338 aa15.09■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 STK38Q15208 465 aa15.09■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM47AQ5JRC9 791 aa15.09■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 STRIP1Q5VSL9 837 aa15.09■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 MYSM1Q5VVJ2 828 aa15.09■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 C16orf86Q6ZW13 317 aa15.09■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCDC125Q86Z20 511 aa15.09■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa15.09■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
NME1-NME2-201ENST00000376392 F8W031 263 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 SMIM22K7EJ46 135 aa15.08■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 ECE2O60344 883 aa15.08■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 NASPP49321 788 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa15.08■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa15.08■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 KCNG4Q8TDN1 519 aa15.08■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 ANKS1AQ92625 1134 aa15.08■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 USP28Q96RU2 1077 aa15.08■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 MAP3K14Q99558 947 aa15.08■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 NUP62CLQ9H1M0 184 aa15.08■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 POLR3EQ9NVU0 708 aa15.08■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa15.08■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 GNAQP50148 359 aa15.07■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa15.07■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCDC93Q567U6 631 aa15.07■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 TMTC3Q6ZXV5 915 aa15.07■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 DEFB132Q7Z7B7 95 aa15.07■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 NBPF11Q86T75 865 aa15.07■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 CERS5Q8N5B7 392 aa15.07■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 TTLL6Q8N841 843 aa15.07■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 JMYQ8N9B5 988 aa15.07■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 DYNLL2Q96FJ2 89 aa15.07■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 MRIQ9BWK5 157 aa15.07■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 DBNDD1Q9H9R9 158 aa15.07■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 BRMS1Q9HCU9 246 aa15.07■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 USP17L3A6NCW0 530 aa15.06■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 USP17L4A6NCW7 530 aa15.06■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 MMP1P03956 469 aa15.06■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 HLA-DOAP06340 250 aa15.06■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 ME1P48163 572 aa15.06■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 CDK8P49336 464 aa15.06■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 KIAA2012Q0VF49 1180 aa15.06■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 TROAPQ12815 778 aa15.06■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 SOGA3Q5TF21 947 aa15.06■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 USP17L1Q7RTZ2 530 aa15.06■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 RTKN2Q8IZC4 609 aa15.06■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 AIFM3Q96NN9 605 aa15.06■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 USP40Q9NVE5 1235 aa15.06■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 SCN9AQ15858 1988 aa15.05■□□□□ 0
NME1-NME2-201ENST00000376392 KIF28PB7ZC32 967 aa15.05■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 RASA1P20936 1047 aa15.05■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP15.05■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 CRKP46108 304 aa15.05■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 PLCD1P51178 756 aa15.05■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 PICALMQ13492 652 aa15.05■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 MAP3K11Q16584 847 aa15.05■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 ANO1Q5XXA6 986 aa15.05■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 C7orf43Q8WVR3 580 aa15.05■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 PGBD1Q96JS3 809 aa15.05■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 TNMDQ9H2S6 317 aa15.05■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 SWAP70Q9UH65 585 aa15.05■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 TAOK2Q9UL54 1235 aa15.05■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 MYO3BQ8WXR4 1341 aa15.05■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 EP400Q96L91 3159 aa15.05■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 SNED1Q8TER0 1413 aa15.04■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A1W2PQ27 194 aa15.04■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A1W2PQ64 194 aa15.04■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A1W2PQD8 194 aa15.04■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPTLC2O15270 562 aa15.04■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 CTAGE5O15320 804 aa15.04■□□□□ -0
NME1-NME2-201ENST00000376392 PPIP5K2O43314 1243 aa15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms