RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368494.3

NUS1-201, Transcript of NUS1, dehydrodolichyl diphosphate synthase subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NUS1, Length 4,676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUS1-201ENST00000368494 POLA2Q14181 598 aa18.42■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 ADORA1P30542 326 aa18.42■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 TNNI2P48788 182 aa18.42■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 SCRN1Q12765 414 aa18.42■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 CTR9Q6PD62 1173 aa18.42■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa18.42■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 LRMPQ12912 555 aa18.42■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa18.42■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa18.42■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 LARGE1O95461 756 aa18.41■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 TERF1P54274 439 aa18.41■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 GOLGA1Q92805 767 aa18.41■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa18.41■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 SASH1O94885 1247 aa18.41■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 KIAA1468Q9P260 1216 aa18.41■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 FBXO3Q9UK99 471 aa18.41■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 MAST3O60307 1309 aa18.41■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 AKNAD1Q5T1N1 836 aa18.41■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 KIAA0825Q8IV33 1275 aa18.41■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 TTLL11Q8NHH1 800 aa18.41■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 SHTN1A0MZ66 631 aa18.41■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 GNA11P29992 359 aa18.41■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 TCP10Q12799 353 aa18.41■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 KRT79Q5XKE5 535 aa18.41■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 NRKQ7Z2Y5 1582 aa18.41■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 IGSF22Q8N9C0 903 aa18.41■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 CCDC42Q96M95 316 aa18.41■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 MYO5BQ9ULV0 1848 aa18.41■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 USP8P40818 1118 aa18.4■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 TBC1D9BQ66K14 1250 aa18.4■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 ERO1AQ96HE7 468 aa18.4■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 VPS16Q9H269 839 aa18.4■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 ADCY9O60503 1353 aa18.4■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 H7C1W4 665 aa18.4■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 CNGA4Q8IV77 575 aa18.4■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 CEP112Q8N8E3 955 aa18.4■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 UBR1Q8IWV7 1749 aa18.4■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 LETM2Q2VYF4 491 aa18.4■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 WWC2Q6AWC2 1192 aa18.4■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 MLKLQ8NB16 471 aa18.4■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 XDHP47989 1333 aa18.4■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 KRT86O43790 486 aa18.4■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 KIF5AQ12840 1032 aa18.4■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 UBE4AQ14139 1066 aa18.4■□□□□ 0.54
NUS1-201ENST00000368494 TBCAO75347 108 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 BBOX1O75936 387 aa18.39■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 PDE6AP16499 860 aa18.39■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 ITSN1Q15811 1721 aa18.39■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 PFKFB1P16118 471 aa18.39■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 ADRA2BP18089 450 aa18.39■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 EPHA10Q5JZY3 1008 aa18.39■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa18.39■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 KRT83P78385 493 aa18.39■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 PCDHA7Q9UN72 937 aa18.39■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 CETN1Q12798 172 aa18.38■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 ERMNQ8TAM6 284 aa18.38■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 IMPACTQ9P2X3 320 aa18.38■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa18.38■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 CD163L1Q9NR16 1453 aa18.38■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 IFFO1Q0D2I5 559 aa18.38■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 STAMQ92783 540 aa18.38■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP18.38■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 ARID5AQ03989 594 aa18.38■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 POSTNQ15063 836 aa18.38■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 DLGAP5Q15398 846 aa18.38■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 TTC38Q5R3I4 469 aa18.38■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 SYCP3Q8IZU3 236 aa18.38■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 CCDC113Q9H0I3 377 aa18.38■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 CTNND2Q9UQB3 1225 aa18.38■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 SCNN1DP51172 638 aa18.38■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 PNOCQ13519 176 aa18.38■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 ZNF408Q9H9D4 720 aa18.38■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 VPS54Q9P1Q0 977 aa18.38■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 TACC1O75410 805 aa18.37■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 EVCP57679 992 aa18.37■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa18.37■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 BICDL2A1A5D9 508 aa18.37■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 RHOXF2BP0C7M4 288 aa18.37■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 CAPZA3Q96KX2 299 aa18.37■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 RHOXF2Q9BQY4 288 aa18.37■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 SAMM50Q9Y512 469 aa18.37■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 CIAO1O76071 339 aa18.37■□□□□ 0.53
NUS1-201ENST00000368494 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP18.37■□□□□ 0.534e-6■□□□□ 10.9
NUS1-201ENST00000368494 NECTIN1Q15223 517 aa18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms