RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 GABRDO14764 452 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 KIF4AO95239 1232 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 NPTXRO95502 500 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 FAM153BP0C7A2 387 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 PHKG2P15735 406 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 GRM5P41594 1212 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 DHCR24Q15392 516 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 FOXB2Q5VYV0 432 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 SLC13A1Q9BZW2 595 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 SAGE1Q9NXZ1 904 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 LZTS1Q9Y250 596 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 TIMM44O43615 452 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 NXPE4Q6UWF7 544 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 KIF2CQ99661 725 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 ABCB6Q9NP58 842 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 OBP2AQ9NY56 170 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 TNKSO95271 1327 aa3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 ZFYVE9O95405 1425 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 C9IYK1 514 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 PIP5K1CO60331 668 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 LDHCP07864 332 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 PJA1Q8NG27 643 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 TCF12Q99081 682 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM63CQ9P1W3 806 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 C5orf42Q9H799 3197 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 A6NHS1 94 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 CCER2I3L3R5 266 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 RXRGP48443 463 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 IER5Q5VY09 327 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 CNPY4Q8N129 248 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 SALL4Q9UJQ4 1053 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 CILPO75339 1184 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 APPP05067 770 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 MCCP23508 829 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 PDE6BP35913 854 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 PWP1Q13610 501 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 KMT5BQ4FZB7 885 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 NIM1KQ8IY84 436 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 GSTCDQ8NEC7 633 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 CHAC2Q8WUX2 184 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 EXOC2Q96KP1 924 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 CLIC5Q9NZA1 410 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 AK9Q5TCS8 1911 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 SDSP20132 328 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 INPP5BP32019 993 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 ADD1P35611 737 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 TM4SF4P48230 202 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 SARSP49591 514 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 ERVK-21P61565 698 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 NBPF8Q3BBV2 869 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 BAP1Q92560 729 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 GJA10Q969M2 543 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 PRDM6Q9NQX0 595 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 UBP1Q9NZI7 540 aa3.19□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 NLRP1Q9C000 1473 aa3.18□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa3.18□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 KDM2BQ8NHM5 1336 aa3.18□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 ENC1O14682 589 aa3.18□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 LPOP22079 712 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 SH3BP2P78314 561 aa3.18□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM240Q5SV17 173 aa3.18□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 ZBTB33Q86T24 672 aa3.18□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM39Q9HCM9 518 aa3.18□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP3.18□□□□□ -1.91e-6■■■■■ 44.2
CCSAP-202ENST00000366686 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa3.18□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 ERVK-7P63135 1459 aa3.18□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PQH9 124 aa3.18□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 PLD2O14939 933 aa3.18□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 GPSM2P81274 684 aa3.18□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 SLC10A5Q5PT55 438 aa3.18□□□□□ -1.9
CCSAP-202ENST00000366686 PERM1Q5SV97 790 aa3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms