RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361201.8

CSAG4-201, Transcript of CSAG family member 4 (pseudogene), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CSAG4, Length 755 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG4-201ENST00000361201 RAG1P15918 1043 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG4-201ENST00000361201 CNGA1P29973 690 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG4-201ENST00000361201 RGS3P49796 1198 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG4-201ENST00000361201 HERVK_113P62684 666 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG4-201ENST00000361201 ERVK-9P63128 1117 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG4-201ENST00000361201 ERVK-24P63145 666 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG4-201ENST00000361201 FAAP100Q0VG06 881 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG4-201ENST00000361201 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
CSAG4-201ENST00000361201 ANO1Q5XXA6 986 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG4-201ENST00000361201 LMBR1LQ6UX01 489 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG4-201ENST00000361201 TSPYL6Q8N831 410 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG4-201ENST00000361201 ARRDC4Q8NCT1 418 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG4-201ENST00000361201 ZNF280CQ8ND82 737 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG4-201ENST00000361201 HERVK_113Q902F9 699 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG4-201ENST00000361201 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CSAG4-201ENST00000361201 CNNM1Q9NRU3 951 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG4-201ENST00000361201 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
CSAG4-201ENST00000361201 MAST3O60307 1309 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG4-201ENST00000361201 ENTPD3O75355 529 aa12.28□□□□□ -0.44
CSAG4-201ENST00000361201 HOXC6P09630 235 aa12.28□□□□□ -0.44
CSAG4-201ENST00000361201 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CSAG4-201ENST00000361201 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP12.28□□□□□ -0.442e-7■□□□□ 10.4
CSAG4-201ENST00000361201 MFSD14CQ5VZR4 134 aa12.28□□□□□ -0.44
CSAG4-201ENST00000361201 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa12.28□□□□□ -0.44
CSAG4-201ENST00000361201 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
CSAG4-201ENST00000361201 CNMDO75829 334 aa12.27□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 FOXK2Q01167 660 aa12.27□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 LRRC41Q15345 812 aa12.27□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 CCDC30Q5VVM6 783 aa12.27□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa12.27□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 CCDC146Q8IYE0 955 aa12.27□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 VGLL2Q8N8G2 317 aa12.27□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 KCNH6Q9H252 994 aa12.27□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 MTCH2Q9Y6C9 303 aa12.27□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa12.27□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 TRIOO75962 3097 aa12.27□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 ZFHX4Q86UP3 3567 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 FAM196BA6NMK8 535 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 TBC1D12O60347 775 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 SLC4A2P04920 1241 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 PRDX5P30044 214 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 MICALL1Q8N3F8 863 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 PHF24Q9UPV7 400 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 CHMP3Q9Y3E7 222 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 CLSPNQ9HAW4 1339 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 MYO15AQ9UKN7 3530 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 ATAD5Q96QE3 1844 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 KBTBD13C9JR72 458 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 RFXAPO00287 272 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 ST18O60284 1047 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 TIMP1P01033 207 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 PTPREP23469 700 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 JAG1P78504 1218 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 CCDC57Q2TAC2 916 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 KRT40Q6A162 431 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 VPS37DQ86XT2 251 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 LINS1Q8NG48 757 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 TMEM39AQ9NV64 488 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 TBX21Q9UL17 535 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 COG5Q9UP83 839 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 CAP2P40123 477 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 GRB14Q14449 540 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 MFSD5Q6N075 450 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 ZNF365Q70YC5 407 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 SLC44A5Q8NCS7 719 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 SLC28A3Q9HAS3 691 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 BRWD1Q9NSI6 2320 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 SLC15A5A6NIM6 579 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 SEPT4O43236 478 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 ACRP10323 421 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 MYOGP15173 224 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 CSF2RAP15509 400 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 KCNA4P22459 653 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 BACE1P56817 501 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 ATP2B2Q01814 1243 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 RAB30Q15771 203 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 CAVIN4Q5BKX8 364 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 FAM47AQ5JRC9 791 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 KAZALD1Q96I82 304 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 TOX2Q96NM4 488 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 WDR18Q9BV38 432 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 MYH16Q9H6N6 1097 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 SMCHD1A6NHR9 2005 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 MROH5Q6ZUA9 1318 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 EPOPA6NHQ4 379 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 USP17L5A8MUK1 530 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 FGFR2P21802 821 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 MTMR2Q13614 643 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 LRRC24Q50LG9 513 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG4-201ENST00000361201 DNAAF4Q8WXU2 420 aa12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms