RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325110.10

HMGCS1-201, Transcript of 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGCS1, Length 3,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCS1-201ENST00000325110 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 CTNND2Q9UQB3 1225 aa14.68□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 HPSEQ9Y251 543 aa14.68□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.68□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.67□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 KRT2P35908 639 aa14.67□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa14.67□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.67□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa14.67□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 KIF5CO60282 957 aa14.67□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 CCDC175P0C221 793 aa14.67□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 PTPREP23469 700 aa14.67□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 MCM6Q14566 821 aa14.67□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 ZNF569Q5MCW4 686 aa14.67□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 SGMS1Q86VZ5 419 aa14.67□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 CHRNDQ07001 517 aa14.66□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 SMIM5Q71RC9 77 aa14.66□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 TMTC2Q8N394 836 aa14.66□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 RIC1Q4ADV7 1423 aa14.66□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 GPIHBP1Q8IV16 184 aa14.66□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 TSPY2A6NKD2 308 aa14.66□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 CAVIN4Q5BKX8 364 aa14.66□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 KANK3Q6NY19 840 aa14.66□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 FBXL16Q8N461 479 aa14.66□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 PLA2G12BQ9BX93 195 aa14.66□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 USP17L12C9JPN9 530 aa14.65□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 USP17L21D6R901 530 aa14.65□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 RHOXF2BP0C7M4 288 aa14.65□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 GNAT2P19087 354 aa14.65□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 TERF2Q15554 542 aa14.65□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 SLC4A9Q96Q91 983 aa14.65□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 RHOXF2Q9BQY4 288 aa14.65□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 HSD3B7Q9H2F3 369 aa14.65□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 NMT2O60551 498 aa14.65□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 SKIDA1Q1XH10 827 aa14.65□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.061e-6■■■□□ 16.4
HMGCS1-201ENST00000325110 TAB2Q9NYJ8 693 aa14.65□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa14.65□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 WDR19Q8NEZ3 1342 aa14.65□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 CCDC66A2RUB6 948 aa14.65□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 ARFGAP3Q9NP61 516 aa14.65□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 INTS13Q9NVM9 706 aa14.65□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 ZNF446Q9NWS9 450 aa14.65□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.65□□□□□ -0.06
HMGCS1-201ENST00000325110 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 CDHR2Q9BYE9 1310 aa14.64□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa14.64□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 RBL2Q08999 1139 aa14.64□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 PTGDRQ13258 359 aa14.64□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 TTC38Q5R3I4 469 aa14.64□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 TICAM2Q86XR7 235 aa14.64□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.64□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.64□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.64□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 CASP14P31944 242 aa14.63□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.63□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 L2HGDHQ9H9P8 463 aa14.63□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 SCN11AQ9UI33 1791 aa14.63□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.63□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa14.63□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 PLCD1P51178 756 aa14.63□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 GYS2P54840 703 aa14.63□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 TC2NQ8N9U0 490 aa14.63□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 RASGRP4Q8TDF6 673 aa14.63□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 STX10O60499 249 aa14.63□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 TXLNAP40222 546 aa14.63□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 ADGRA1Q86SQ6 560 aa14.62□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 ACRBPQ8NEB7 543 aa14.62□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 NEK11Q8NG66 645 aa14.62□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 PARP3Q9Y6F1 533 aa14.62□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 ABCC12Q96J65 1359 aa14.62□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa14.62□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 SLFN14P0C7P3 912 aa14.62□□□□□ -0.07
HMGCS1-201ENST00000325110 TRIM65Q6PJ69 517 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms