RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa23.12■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 PFKFB2O60825 505 aa23.12■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 TSPY3P0CV98 308 aa23.12■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 TSPY8P0CW00 308 aa23.12■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC178Q5BJE1 867 aa23.12■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 GTF3C6Q969F1 213 aa23.12■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.12■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.12■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 EPS15P42566 896 aa23.12■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 NFXL1Q6ZNB6 911 aa23.12■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.12■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 NECAB1Q8N987 351 aa23.12■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 CSRNP1Q96S65 589 aa23.12■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa23.12■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 SHMT1P34896 483 aa23.11■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 ST3GAL1Q11201 340 aa23.11■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 STK3Q13188 491 aa23.11■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 CHMP4CQ96CF2 233 aa23.11■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 TRIM34Q9BYJ4 488 aa23.11■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 PLIN4Q96Q06 1357 aa23.11■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC69A6NI79 296 aa23.1■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 APOA5Q6Q788 366 aa23.1■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 NEDD1Q8NHV4 660 aa23.1■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.1■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 DNAJC18Q9H819 358 aa23.1■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 SENP2Q9HC62 589 aa23.1■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 GOLGA8BA8MQT2 603 aa23.09■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 HACL1Q9UJ83 578 aa23.09■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 DDIT3P35638 169 aa23.09■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC17Q96LX7 622 aa23.09■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM39BQ9GZU3 492 aa23.09■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.09■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 NMT2O60551 498 aa23.08■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 RCAN1P53805 252 aa23.08■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 SCRN1Q12765 414 aa23.08■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa23.08■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 DGKHQ86XP1 1220 aa23.08■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 IL17RBQ9NRM6 502 aa23.08■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 HPS5Q9UPZ3 1129 aa23.08■■□□□ 1.29
CCDC71-201ENST00000321895 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 GLTPD2A6NH11 291 aa23.07■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 RASA3Q14644 834 aa23.07■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 TATDN1Q6P1N9 297 aa23.07■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 ANKS1AQ92625 1134 aa23.07■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.07■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 NID2Q14112 1375 aa23.07■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 ZBTB43O43298 467 aa23.06■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 RCSD1Q6JBY9 416 aa23.06■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF654Q8IZM8 581 aa23.06■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.06■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 SCN4AP35499 1836 aa23.05■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 FAM196BA6NMK8 535 aa23.05■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 TBC1D12O60347 775 aa23.05■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 AKR1B1P15121 316 aa23.05■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 CCT2P78371 535 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 MICU3Q86XE3 530 aa23.05■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa23.04■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 CATIPQ7Z7H3 387 aa23.04■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 GGA3Q9NZ52 723 aa23.04■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 SLURP2P0DP57 97 aa23.04■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 TEPSINQ96N21 525 aa23.04■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.04■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.04■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa23.03■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 GOLGA8AA7E2F4 631 aa23.03■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 DDAH1O94760 285 aa23.03■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 NOVP48745 357 aa23.03■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.03■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 CALM1P0DP23 149 aa23.02■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 CALM2P0DP24 149 aa23.02■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 CALM3P0DP25 149 aa23.02■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 MAP3K10Q02779 954 aa23.02■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.02■■□□□ 1.28
CCDC71-201ENST00000321895 CDAN1Q8IWY9 1227 aa23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms