RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297163.3

SMAD5-AS1-201, SMAD5 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD5-AS1, Length 1,816 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP9.21□□□□□ -0.94
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FSD1Q9BTV5 496 aa9.19□□□□□ -0.94
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RILPL2Q969X0 211 aa9.17□□□□□ -0.94
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 OPTNQ96CV9 577 aa9.17□□□□□ -0.94
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 WNK4Q96J92 1243 aa9.17□□□□□ -0.94
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ELP3Q9H9T3 547 aa9.17□□□□□ -0.94
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP9.17□□□□□ -0.94
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 WBP1LQ9NX94 342 aa9.17□□□□□ -0.94
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MCM9Q9NXL9 1143 aa9.17□□□□□ -0.94
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa9.17□□□□□ -0.94
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SPDYE5A6NIY4 337 aa9.16□□□□□ -0.94
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