RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288022.1

PDF-201, Transcript of peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDF, Length 1,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDF-201ENST00000288022 USP17L21D6R901 530 aa30.16■■■□□ 2.42
PDF-201ENST00000288022 JAG1P78504 1218 aa30.16■■■□□ 2.42
PDF-201ENST00000288022 SPP2Q13103 211 aa30.16■■■□□ 2.42
PDF-201ENST00000288022 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
PDF-201ENST00000288022 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
PDF-201ENST00000288022 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa30.16■■■□□ 2.42
PDF-201ENST00000288022 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
PDF-201ENST00000288022 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
PDF-201ENST00000288022 ANKRD23Q86SG2 305 aa30.16■■■□□ 2.42
PDF-201ENST00000288022 ZNF280CQ8ND82 737 aa30.16■■■□□ 2.42
PDF-201ENST00000288022 OSBPL3Q9H4L5 887 aa30.16■■■□□ 2.42
PDF-201ENST00000288022 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
PDF-201ENST00000288022 GINM1Q9NU53 330 aa30.16■■■□□ 2.42
PDF-201ENST00000288022 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa30.16■■■□□ 2.42
PDF-201ENST00000288022 APPP05067 770 aa30.15■■■□□ 2.42
PDF-201ENST00000288022 GNAT2P19087 354 aa30.15■■■□□ 2.42
PDF-201ENST00000288022 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
PDF-201ENST00000288022 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa30.14■■■□□ 2.42
PDF-201ENST00000288022 PDHXO00330 501 aa30.14■■■□□ 2.42
PDF-201ENST00000288022 FKTNO75072 461 aa30.14■■■□□ 2.42
PDF-201ENST00000288022 GH2P01242 217 aa30.14■■■□□ 2.42
PDF-201ENST00000288022 SHMT1P34896 483 aa30.14■■■□□ 2.42
PDF-201ENST00000288022 GABPAQ06546 454 aa30.14■■■□□ 2.42
PDF-201ENST00000288022 MOGSQ13724 837 aa30.14■■■□□ 2.42
PDF-201ENST00000288022 GSG1L2A8MUP6 293 aa30.13■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 ABCB5Q2M3G0 1257 aa30.13■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 C12orf60Q5U649 245 aa30.13■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 DYNLL2Q96FJ2 89 aa30.13■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 CTR9Q6PD62 1173 aa30.12■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 CABP5Q9NP86 173 aa30.12■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 SWAP70Q9UH65 585 aa30.12■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 PTPRFP10586 1907 aa30.12■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 PDE4AP27815 886 aa30.11■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 TDO2P48775 406 aa30.11■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 DGKZQ13574 1117 aa30.11■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 GIMAP6Q6P9H5 292 aa30.11■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 SLC44A5Q8NCS7 719 aa30.11■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 WDR18Q9BV38 432 aa30.11■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 HMGCS2P54868 508 aa30.1■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 RAB3GAP1Q15042 981 aa30.1■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 GPAT2Q6NUI2 795 aa30.1■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 MTMR2Q13614 643 aa30.09■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa30.09■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 NACAP1Q9BZK3 213 aa30.09■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 TAOK2Q9UL54 1235 aa30.09■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 MINDY4BA8MYZ0 360 aa30.08■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 SMIM22K7EJ46 135 aa30.08■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 HELLSQ9NRZ9 838 aa30.08■■■□□ 2.41
PDF-201ENST00000288022 MYH8P13535 1937 aa30.07■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 TLR2O60603 784 aa30.07■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 SBK1Q52WX2 424 aa30.07■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 TICAM2Q86XR7 235 aa30.07■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 IFNL3Q8IZI9 196 aa30.07■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 FAM227BQ96M60 508 aa30.07■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa30.07■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 USP17L10C9JJH3 530 aa30.06■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 CDK8P49336 464 aa30.06■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 BACE1P56817 501 aa30.06■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 SP3Q02447 781 aa30.06■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 C16orf86Q6ZW13 317 aa30.06■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 MCOLN1Q9GZU1 580 aa30.06■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 TMOD4Q9NZQ9 345 aa30.06■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 NEFLP07196 543 aa30.05■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 TREML2Q5T2D2 321 aa30.05■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 STK11IPQ8N1F8 1099 aa30.05■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 ERO1AQ96HE7 468 aa30.05■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 FEZ1Q99689 392 aa30.05■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 NAPBQ9H115 298 aa30.05■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 LOC285556D6RIA3 1793 aa30.05■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 A0A0D9SFI3 127 aa30.04■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 C19orf81C9J6K1 198 aa30.04■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 CYP2C8P10632 490 aa30.04■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 SDSP20132 328 aa30.04■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 SEPT2Q15019 361 aa30.04■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa30.04■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 SH3D19Q5HYK7 790 aa30.04■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 CD99L2Q8TCZ2 262 aa30.04■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 CPA4Q9UI42 421 aa30.04■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa30.04■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 AKR1B1P15121 316 aa30.02■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP30.02■■■□□ 2.41e-6■□□□□ 9.5
PDF-201ENST00000288022 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 TTC22Q5TAA0 569 aa30.02■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 TMEM179Q6ZVK1 233 aa30.02■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 CCDC17Q96LX7 622 aa30.02■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa30.02■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 PNMA3Q9UL41 463 aa30.02■■■□□ 2.4
PDF-201ENST00000288022 GUCY1A2P33402 732 aa30.01■■■□□ 2.39
PDF-201ENST00000288022 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
PDF-201ENST00000288022 MKNK2Q9HBH9 465 aa30.01■■■□□ 2.39
PDF-201ENST00000288022 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
PDF-201ENST00000288022 USP17L2Q6R6M4 530 aa30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms