RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000023343.3

Atg3-201, Transcript of Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Atg3, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3-201ENSMUST00000023343 VrtnQ3SYK4 740 aa23.49■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Ccp110Q7TSH4 1004 aa23.49■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Tcp11l1Q8BTG3 509 aa23.49■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Clip2Q9Z0H8 1047 aa23.49■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 UncxO08934 530 aa23.48■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Cfap157Q0VFX2 523 aa23.48■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Kmt5bQ3U8K7 883 aa23.48■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Mxd3Q80US8 206 aa23.48■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Mboat7Q8CHK3 473 aa23.48■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Zfp831A2ADM8 1628 aa23.48■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Apba2P98084 750 aa23.48■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Prom2Q3UUY6 835 aa23.48■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 MycbpapQ5SUV2 932 aa23.48■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 DaglaQ6WQJ1 1044 aa23.48■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Zfp202Q8C879 641 aa23.48■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Myoz2Q9JJW5 264 aa23.48■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Gpaa1Q9WTK3 621 aa23.48■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Rec8Q8C5S7 591 aa23.47■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Cdk8Q8R3L8 464 aa23.47■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Lonrf3Q9D4H7 753 aa23.47■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Mtmr2Q9Z2D1 643 aa23.47■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Btaf1E9QAE3 1848 aa23.47■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Ktn1Q61595 1327 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Brpf3B2KF05 1204 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Tpd52l1O54818 204 aa23.47■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Stac3Q8BZ71 360 aa23.47■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Mad2l2Q9D752 211 aa23.47■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Mmel1Q9JLI3 765 aa23.47■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Ecm29Q6PDI5 1840 aa23.46■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Fam186bD3Z420 943 aa23.46■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Il7P10168 154 aa23.46■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Cyp7b1Q60991 507 aa23.46■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Cyp4x1Q6A152 507 aa23.46■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Atp2b4Q6Q477 1205 aa23.46■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Pip5kl1Q6U7H8 395 aa23.46■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Rc3h1Q4VGL6 1130 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Skor1Q8BX46 964 aa23.45■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 RadxQ8C779 850 aa23.45■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Hmgn5Q9JL35 406 aa23.45■■□□□ 1.35
Atg3-201ENSMUST00000023343 Eya3P97480 510 aa23.45■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Fam178bQ24JP3 464 aa23.45■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Prpf4bQ61136 1007 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Tm4sf1Q64302 202 aa23.45■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Anp32cQ64G17 123 aa23.45■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Haus7Q8BKT8 364 aa23.45■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Atp2b1G5E829 1220 aa23.44■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Epb41l2O70318 988 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Smc2Q8CG48 1191 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Xrcc4Q924T3 326 aa23.44■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Ccdc88aQ5SNZ0 1873 aa23.44■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Pfkfb3A7UAK5 555 aa23.44■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 EgfrQ01279 1210 aa23.44■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Znf653Q6YND2 615 aa23.44■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Txnrd3Q99MD6 652 aa23.44■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Ndufb9Q9CQJ8 179 aa23.44■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Mrps25Q9D125 171 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Vmn2r68L7N2B3 851 aa23.43■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Stag2O35638 1231 aa23.43■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Dapk3O54784 448 aa23.43■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Arhgef16Q3U5C8 713 aa23.43■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Larp6Q8BN59 492 aa23.43■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Tmem47Q9JJG6 181 aa23.43■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Myh8P13542 1937 aa23.43■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Cspp1B2RX88 1205 aa23.42■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Fbln2P37889 1221 aa23.42■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Prl2c1Q5SVL9 228 aa23.42■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Tango6Q8C3S2 1079 aa23.42■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Ccdc150Q8CDI7 1110 aa23.42■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Hic2Q9JLZ6 619 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Ces1aE9PYP1 563 aa23.42■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 EzrP26040 586 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Tbc1d2bQ3U0J8 965 aa23.42■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Paxip1Q6NZQ4 1056 aa23.42■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Dnaaf2Q8BPI1 814 aa23.42■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Ripk4Q9ERK0 786 aa23.42■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Stxbp4Q9WV89 557 aa23.42■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Zscan18E9PUD6 809 aa23.41■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Zscan29E9Q5B4 869 aa23.41■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Usp5P56399 858 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Bach2P97303 839 aa23.41■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 OplahQ8K010 1288 aa23.41■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Golph3lQ8R088 285 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Krt23Q99PS0 422 aa23.41■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Ppef2O35385 757 aa23.4■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 GnaqP21279 359 aa23.4■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Grin1P35438 938 aa23.4■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Pank2Q3U4S0 443 aa23.4■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Ddrgk1Q80WW9 315 aa23.4■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Rbm19Q8R3C6 952 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Znf287Q9EQB9 759 aa23.4■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 RabggtaQ9JHK4 567 aa23.4■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Ifi207E9Q3L4 978 aa23.4■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Phldb3E9QAF4 648 aa23.4■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Nap1l2P51860 460 aa23.4■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Eef2P58252 858 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 MyrflQ3UN70 904 aa23.4■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Ncbp1Q3UYV9 790 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Mars2Q499X9 586 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Insm1Q63ZV0 521 aa23.4■■□□□ 1.34
Atg3-201ENSMUST00000023343 Tacc1Q6Y685 774 aa23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 89.6 ms