RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622233.1

RAB28P4-201, Transcript of RAB28, member RAS oncogene family pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene RAB28P4, Length 665 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P4-201ENST00000622233 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RAB28P4-201ENST00000622233 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RAB28P4-201ENST00000622233 MUC3BQ9H195 1237 aa9.62□□□□□ -0.87
RAB28P4-201ENST00000622233 TRAK1Q9UPV9 953 aa9.62□□□□□ -0.87
RAB28P4-201ENST00000622233 ANKARQ7Z5J8 1434 aa9.62□□□□□ -0.87
RAB28P4-201ENST00000622233 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.61□□□□□ -0.87
RAB28P4-201ENST00000622233 AMPD1P23109 780 aa9.61□□□□□ -0.87
RAB28P4-201ENST00000622233 NBPF8Q3BBV2 869 aa9.61□□□□□ -0.87
RAB28P4-201ENST00000622233 C3orf58Q8NDZ4 430 aa9.61□□□□□ -0.87
RAB28P4-201ENST00000622233 FRRS1LQ9P0K9 344 aa9.61□□□□□ -0.87
RAB28P4-201ENST00000622233 FAM8A1Q9UBU6 413 aa9.61□□□□□ -0.87
RAB28P4-201ENST00000622233 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RAB28P4-201ENST00000622233 ATP7BP35670 1465 aa9.6□□□□□ -0.87
RAB28P4-201ENST00000622233 PXDNQ92626 1479 aa9.6□□□□□ -0.87
RAB28P4-201ENST00000622233 A0A096LPE4 126 aa9.6□□□□□ -0.87
RAB28P4-201ENST00000622233 A0A1W2PPZ6 126 aa9.6□□□□□ -0.87
RAB28P4-201ENST00000622233 GIPC1O14908 333 aa9.6□□□□□ -0.87
RAB28P4-201ENST00000622233 CDC25BP30305 580 aa9.6□□□□□ -0.87
RAB28P4-201ENST00000622233 SVOPQ8N4V2 548 aa9.6□□□□□ -0.87
RAB28P4-201ENST00000622233 AKAP2Q9Y2D5 859 aa9.6□□□□□ -0.87
RAB28P4-201ENST00000622233 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RAB28P4-201ENST00000622233 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RAB28P4-201ENST00000622233 FBXO24O75426 580 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB28P4-201ENST00000622233 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RAB28P4-201ENST00000622233 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
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RAB28P4-201ENST00000622233 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
RAB28P4-201ENST00000622233 TMEM87AQ8NBN3 555 aa9.59□□□□□ -0.87
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RAB28P4-201ENST00000622233 JCADQ9P266 1359 aa9.59□□□□□ -0.87
RAB28P4-201ENST00000622233 BAG6P46379 1132 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB28P4-201ENST00000622233 TXNDC11Q6PKC3 985 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB28P4-201ENST00000622233 DTHD1Q6ZMT9 781 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB28P4-201ENST00000622233 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB28P4-201ENST00000622233 POGKQ9P215 609 aa9.58□□□□□ -0.88
RAB28P4-201ENST00000622233 ABCA3Q99758 1704 aa9.58□□□□□ -0.88
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RAB28P4-201ENST00000622233 PRR36Q9H6K5 1346 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB28P4-201ENST00000622233 LRP6O75581 1613 aa9.57□□□□□ -0.88
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RAB28P4-201ENST00000622233 EPHA1P21709 976 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB28P4-201ENST00000622233 FAAP100Q0VG06 881 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB28P4-201ENST00000622233 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
RAB28P4-201ENST00000622233 VN1R5Q7Z5H4 357 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB28P4-201ENST00000622233 CRELD1Q96HD1 420 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB28P4-201ENST00000622233 SOX13Q9UN79 622 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB28P4-201ENST00000622233 ALS2Q96Q42 1657 aa9.57□□□□□ -0.88
RAB28P4-201ENST00000622233 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
RAB28P4-201ENST00000622233 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa9.56□□□□□ -0.88
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RAB28P4-201ENST00000622233 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa9.56□□□□□ -0.88
RAB28P4-201ENST00000622233 LILRB5O75023 590 aa9.56□□□□□ -0.88
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RAB28P4-201ENST00000622233 IL22RA1Q8N6P7 574 aa9.56□□□□□ -0.88
RAB28P4-201ENST00000622233 NEDD1Q8NHV4 660 aa9.56□□□□□ -0.88
RAB28P4-201ENST00000622233 BSNDQ8WZ55 320 aa9.56□□□□□ -0.88
RAB28P4-201ENST00000622233 TTC9Q92623 222 aa9.56□□□□□ -0.88
RAB28P4-201ENST00000622233 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
RAB28P4-201ENST00000622233 ZNF576Q9H609 170 aa9.56□□□□□ -0.88
RAB28P4-201ENST00000622233 RRAGCQ9HB90 399 aa9.56□□□□□ -0.88
RAB28P4-201ENST00000622233 PPP4R2Q9NY27 417 aa9.56□□□□□ -0.88
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RAB28P4-201ENST00000622233 ARHGEF15O94989 841 aa9.55□□□□□ -0.88
RAB28P4-201ENST00000622233 CDC27P30260 824 aa9.55□□□□□ -0.88
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RAB28P4-201ENST00000622233 TPTE2Q6XPS3 522 aa9.55□□□□□ -0.88
RAB28P4-201ENST00000622233 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
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RAB28P4-201ENST00000622233 BCL11AQ9H165 835 aa9.54□□□□□ -0.88
RAB28P4-201ENST00000622233 IGSF5Q9NSI5 407 aa9.54□□□□□ -0.88
RAB28P4-201ENST00000622233 LRRC4BQ9NT99 713 aa9.54□□□□□ -0.88
RAB28P4-201ENST00000622233 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa9.54□□□□□ -0.88
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RAB28P4-201ENST00000622233 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RAB28P4-201ENST00000622233 PCDH1Q08174 1060 aa9.52□□□□□ -0.89
RAB28P4-201ENST00000622233 TNS3Q68CZ2 1445 aa9.52□□□□□ -0.89
RAB28P4-201ENST00000622233 MSL1Q68DK7 614 aa9.52□□□□□ -0.89
RAB28P4-201ENST00000622233 NRKQ7Z2Y5 1582 aa9.52□□□□□ -0.89
RAB28P4-201ENST00000622233 MON2Q7Z3U7 1717 aa9.52□□□□□ -0.89
RAB28P4-201ENST00000622233 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
RAB28P4-201ENST00000622233 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
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