RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 MYO15AQ9UKN7 3530 aa9.6□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa9.59□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 MROH5Q6ZUA9 1318 aa9.59□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 F8W031 263 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 CIAO1O76071 339 aa9.59□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 KCNJ4P48050 445 aa9.59□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 ATP8B2P98198 1209 aa9.59□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 TRIM32Q13049 653 aa9.59□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 SHHQ15465 462 aa9.59□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 C20orf194Q5TEA3 1177 aa9.59□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 ANKRD44Q8N8A2 993 aa9.59□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 CRBNQ96SW2 442 aa9.59□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
ZNF548-208ENST00000597576 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa9.58□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 GBF1Q92538 1859 aa9.58□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 HMGCRP04035 888 aa9.58□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 IL15P40933 162 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 GRIN2CQ14957 1233 aa9.58□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa9.58□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 ERICH6BQ5W0A0 696 aa9.58□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 WRNIP1Q96S55 665 aa9.58□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 C11orf16Q9NQ32 467 aa9.58□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 COPRSQ9NQ92 184 aa9.58□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 AKAP2Q9Y2D5 859 aa9.58□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 DMDP11532 3685 aa9.58□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 LOC285556D6RIA3 1793 aa9.58□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 EYA2O00167 538 aa9.57□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 IL1R1P14778 569 aa9.57□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 METTL24Q5JXM2 366 aa9.57□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 EPHA10Q5JZY3 1008 aa9.57□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 CEP85Q6P2H3 762 aa9.57□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 SSH3Q8TE77 659 aa9.57□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 KAZALD1Q96I82 304 aa9.57□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 CEP126Q9P2H0 1117 aa9.57□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 DOCK2Q92608 1830 aa9.56□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 DOCK1Q14185 1865 aa9.56□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 TCP10L2B9ZVM9 353 aa9.56□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 RAB11FIP3O75154 756 aa9.56□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.56□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 THEGQ9P2T0 379 aa9.56□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 SERPINA10Q9UK55 444 aa9.56□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 CACNA1BQ00975 2339 aa9.56□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 SURF6O75683 361 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 INPP5BP32019 993 aa9.55□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 CHRNDQ07001 517 aa9.55□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 POLA2Q14181 598 aa9.55□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 LHX8Q68G74 356 aa9.55□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 EPHX3Q9H6B9 360 aa9.55□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 GJD2Q9UKL4 321 aa9.55□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 LRRC37A2A6NM11 1700 aa9.55□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 EPG5Q9HCE0 2579 aa9.55□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa9.54□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 SNAP23O00161 211 aa9.54□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 BMP1P13497 986 aa9.54□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 SLC5A1P13866 664 aa9.54□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 MRE11P49959 708 aa9.54□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 UBE4AQ14139 1066 aa9.54□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 CAVIN4Q5BKX8 364 aa9.54□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 AKNAD1Q5T1N1 836 aa9.54□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 POTEEQ6S8J3 1075 aa9.54□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 VPS37DQ86XT2 251 aa9.54□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 EXOC6Q8TAG9 804 aa9.54□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 TRIB2Q92519 343 aa9.54□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 KIF1BPQ96EK5 621 aa9.54□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 SIL1Q9H173 461 aa9.54□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF112Q9UJU3 913 aa9.54□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 JAG2Q9Y219 1238 aa9.54□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 PDE8BO95263 885 aa9.53□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP9.53□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF804AQ7Z570 1209 aa9.53□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 LPIN2Q92539 896 aa9.53□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 GPR108Q9NPR9 543 aa9.53□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 TAOK2Q9UL54 1235 aa9.53□□□□□ -0.88
ZNF548-208ENST00000597576 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms