RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592582.5

SEH1L-210, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 4,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-210ENST00000592582 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 PXDNQ92626 1479 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 A0A1B0GUA9 196 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 TMC6Q7Z403 805 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 CARD6Q9BX69 1037 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 PAG1Q9NWQ8 432 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 LIMD1Q9UGP4 676 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 H7C1W4 665 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 PES1O00541 588 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 CYP27B1O15528 508 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 GYS2P54840 703 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 PHOX2BQ99453 314 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 DSCC1Q9BVC3 393 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 KCPQ6ZWJ8 1503 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 CPLX1O14810 134 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 PLA2G4AP47712 749 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 TADA2BQ86TJ2 420 aa6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 KIF3CO14782 793 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 TAF5LO75529 589 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 ERCC3P19447 782 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 GNG11P61952 73 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 SARM1Q6SZW1 724 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 NYAP1Q6ZVC0 841 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 CEP112Q8N8E3 955 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 IQUBQ8NA54 791 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 RABGGTAQ92696 567 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 MTMR6Q9Y217 621 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 A0A0D9SFI3 127 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 TUBB2AQ13885 445 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 NECAB1Q8N987 351 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 RUFY1Q96T51 708 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 DBNDD2Q9BQY9 259 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 TUBB2BQ9BVA1 445 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC151A5D8V7 595 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 SERPINC1P01008 464 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 STK3Q13188 491 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 CRACR2AQ9BSW2 395 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 CHD4Q14839 1912 aa6.8□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 PPFIA4O75335 1185 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 INPP5BP32019 993 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 NEDD9Q14511 834 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 ME3Q16798 604 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 KIAA1328Q86T90 577 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 FERMT3Q86UX7 667 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 FAM71BQ8TC56 605 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 CERKQ8TCT0 537 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 CNNM1Q9NRU3 951 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 SH3TC1Q8TE82 1336 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 A6NNZ2 444 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 CDKL5O76039 1030 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 CORO7P57737 925 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 ST5P78524 1137 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 TCIRG1Q13488 830 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 PPP2R5AQ15172 486 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 TUBB8Q3ZCM7 444 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 METTL24Q5JXM2 366 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 KLHDC4Q8TBB5 520 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 AFAP1L1Q8TED9 768 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 SLAIN2Q9P270 581 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 CPA1P15085 419 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 EZRP15311 586 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 QPCTQ16769 361 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 Q6ZUG5 572 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 VEZTQ9HBM0 779 aa6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SEH1L-210ENST00000592582 NDUFV2P19404 249 aa6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms