RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLURP2	P0DP57	97 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRDN	Q13061	729 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	RASA3	Q14644	834 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		10.85	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576		B4E1Z4	1266 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	HLA-DOA	P06340	250 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNFAIP1	Q13829	316 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	NCOA7	Q8NI08	942 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	CSRNP1	Q96S65	589 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	FGR	P09769	529 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNNI2	P48788	182 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDE4B	Q07343	736 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	RUFY3	Q7L099	469 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHST3	Q7LGC8	479 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	LAMB1	P07942	1786 aa		10.84	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	GABPA	Q06546	454 aa		10.83	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		10.83	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	10.83	□□□□□ -0.67
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM196B	A6NMK8	535 aa		10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	KDM4A	O75164	1064 aa		10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPS6KB1	P23443	525 aa		10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDK8	P49336	464 aa		10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRT23	Q9C075	422 aa		10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	SCN4A	P35499	1836 aa		10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	WDR90	Q96KV7	1748 aa		10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	ORC4	O43929	436 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	TEPSIN	Q96N21	525 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	EHD4	Q9H223	541 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	DNAJC18	Q9H819	358 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	RRAGC	Q9HB90	399 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	MCM5	P33992	734 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANTXR2	P58335	489 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	ESR2	Q92731	530 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	TTC14	Q96N46	770 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		10.82	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	ST18	O60284	1047 aa		10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRC1	O43663	620 aa		10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	POTEI	P0CG38	1075 aa		10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	POTEJ	P0CG39	1038 aa		10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	RASA1	P20936	1047 aa		10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	SHMT1	P34896	483 aa		10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	SIPA1L1	O43166	1804 aa		10.81	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	DLK2	Q6UY11	383 aa		10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	SULF1	Q8IWU6	871 aa		10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	SWAP70	Q9UH65	585 aa		10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	TSPY2	A6NKD2	308 aa		10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	AK2	P54819	239 aa		10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	TFAP4	Q01664	338 aa		10.8	□□□□□ -0.68
EFTUD2-223	ENST00000592576	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.4 ms