RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 SALL1Q9NSC2 1324 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 CPLX1O14810 134 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 GPAA1O43292 621 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 PDE8BO95263 885 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 CD46P15529 392 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 ADD2P35612 726 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 BRAPQ7Z569 592 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 LPIN2Q92539 896 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 ARID3AQ99856 593 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRC2Q9BYS8 371 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 GREM2Q9H772 168 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC87Q9NVE4 849 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 DACT1Q9NYF0 836 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 RTL9Q8NET4 1388 aa10.74□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 NRAPQ86VF7 1730 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 KINO60870 393 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 LIG1P18858 919 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 MAP2K5Q13163 448 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF34Q8IZ26 560 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF652Q9Y2D9 606 aa10.73□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 NUP98P52948 1817 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 IRF6O14896 467 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 CHGBP05060 677 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 GNAT2P19087 354 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 MCAMP43121 646 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 MAP3K12Q12852 859 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 HLFQ16534 295 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 STX1AQ16623 288 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC152Q4G0S7 254 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 VGLL2Q8N8G2 317 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNG4Q8TDN1 519 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 C8orf76Q96K31 380 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM87BQ96K49 555 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 RCOR1Q9UKL0 485 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 TIAM2Q8IVF5 1701 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 NWD2Q9ULI1 1742 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 IDH1O75874 414 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 CTDNEP1O95476 244 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 YEATS4O95619 227 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 FGAP02671 866 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 PDE6AP16499 860 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 RPIAP49247 311 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 CCT2P78371 535 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM160A1Q05DH4 1040 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 SCARF1Q14162 830 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 ALX1Q15699 326 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 DDB1Q16531 1140 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 TTLL5Q6EMB2 1281 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM173BQ6P4H8 233 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 PIBF1Q8WXW3 757 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 AIDAQ96BJ3 306 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 MPHOSPH8Q99549 860 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 NACAP1Q9BZK3 213 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 CNNM2Q9H8M5 875 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 AAASQ9NRG9 546 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 DACH1Q9UI36 760 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 MRVI1Q9Y6F6 885 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-222ENST00000592408 PHLPP1O60346 1717 aa10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF831Q5JPB2 1677 aa10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 UBN2Q6ZU65 1347 aa10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF532Q9HCE3 1301 aa10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1W2PQ27 194 aa10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1W2PQ64 194 aa10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1W2PQD8 194 aa10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 APPP05067 770 aa10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 ME1P48163 572 aa10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 EIF5P55010 431 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 HAND2P61296 217 aa10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 CAMK4Q16566 473 aa10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 ANO6Q4KMQ2 910 aa10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC102BQ68D86 513 aa10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 SPATA5Q8NB90 893 aa10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 WASF1Q92558 559 aa10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-222ENST00000592408 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.9 ms