RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591412.5

CTIF-210, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 491 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-210ENST00000591412 PLCG2P16885 1265 aa16.26■□□□□ 0.19
CTIF-210ENST00000591412 TRIM47Q96LD4 638 aa16.26■□□□□ 0.19
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CTIF-210ENST00000591412 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa16.26■□□□□ 0.19
CTIF-210ENST00000591412 FLT1P17948 1338 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-210ENST00000591412 TRIM75PA6NK02 468 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-210ENST00000591412 CAP2P40123 477 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-210ENST00000591412 PSMC4P43686 418 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-210ENST00000591412 PRMT2P55345 433 aa16.25■□□□□ 0.19
CTIF-210ENST00000591412 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa16.25■□□□□ 0.19
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CTIF-210ENST00000591412 TBC1D2Q9BYX2 928 aa16.23■□□□□ 0.19
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CTIF-210ENST00000591412 RCAN3Q9UKA8 241 aa16.23■□□□□ 0.19
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CTIF-210ENST00000591412 USP17L5A8MUK1 530 aa16.21■□□□□ 0.19
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CTIF-210ENST00000591412 MYPNQ86TC9 1320 aa16.2■□□□□ 0.18
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CTIF-210ENST00000591412 SH3D19Q5HYK7 790 aa16.2■□□□□ 0.18
CTIF-210ENST00000591412 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP16.2■□□□□ 0.18
CTIF-210ENST00000591412 WDR18Q9BV38 432 aa16.2■□□□□ 0.18
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CTIF-210ENST00000591412 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa16.2■□□□□ 0.18
CTIF-210ENST00000591412 HMGCS2P54868 508 aa16.19■□□□□ 0.18
CTIF-210ENST00000591412 PRKCZQ05513 592 aa16.19■□□□□ 0.18
CTIF-210ENST00000591412 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
CTIF-210ENST00000591412 C20orf194Q5TEA3 1177 aa16.19■□□□□ 0.18
CTIF-210ENST00000591412 CERS3Q8IU89 383 aa16.19■□□□□ 0.18
CTIF-210ENST00000591412 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
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CTIF-210ENST00000591412 AS3MTQ9HBK9 375 aa16.19■□□□□ 0.18
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CTIF-210ENST00000591412 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa16.18■□□□□ 0.18
CTIF-210ENST00000591412 RAET1EQ8TD07 263 aa16.18■□□□□ 0.18
CTIF-210ENST00000591412 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CTIF-210ENST00000591412 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CTIF-210ENST00000591412 GINM1Q9NU53 330 aa16.18■□□□□ 0.18
CTIF-210ENST00000591412 PNMA3Q9UL41 463 aa16.18■□□□□ 0.18
CTIF-210ENST00000591412 GABRQQ9UN88 632 aa16.18■□□□□ 0.18
CTIF-210ENST00000591412 LOC285556D6RIA3 1793 aa16.18■□□□□ 0.18
CTIF-210ENST00000591412 ATAD5Q96QE3 1844 aa16.17■□□□□ 0.18
CTIF-210ENST00000591412 MYCP01106 439 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CTIF-210ENST00000591412 HLA-DOAP06340 250 aa16.17■□□□□ 0.18
CTIF-210ENST00000591412 GRK4P32298 578 aa16.17■□□□□ 0.18
CTIF-210ENST00000591412 BACE1P56817 501 aa16.17■□□□□ 0.18
CTIF-210ENST00000591412 PDE3AQ14432 1141 aa16.17■□□□□ 0.18
CTIF-210ENST00000591412 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CTIF-210ENST00000591412 MTFR1Q15390 333 aa16.17■□□□□ 0.18
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