RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 LRFN2Q9ULH4 789 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 NUP188Q5SRE5 1749 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 ERVH48-1M5A8F1 160 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 RPS6KA4O75676 772 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 PCSK2P16519 638 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 POLD1P28340 1107 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 ANAPC15P60006 121 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 Q6ZVU0 165 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 CKAP2LQ8IYA6 745 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00116Q8NCU8 138 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 AGBL1Q96MI9 1066 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 OSBPL3Q9H4L5 887 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 GGT7Q9UJ14 662 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 CHMP3Q9Y3E7 222 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 DOT1LQ8TEK3 1739 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 JAZF1Q86VZ6 243 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 CERS3Q8IU89 383 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC9A9Q8IVB4 645 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 TTC5Q8N0Z6 440 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 A6NJY4 79 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 TTLL8A6PVC2 850 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 BTBD11A6QL63 1104 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 GNRH1P01148 92 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 PDGFAP04085 211 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 ST13P50502 369 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 PTSQ03393 145 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF790Q6PG37 636 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 MCM10Q7L590 875 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 DNAJC10Q8IXB1 793 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 SERTAD1Q9UHV2 236 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 MAP3K5Q99683 1374 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 LY75O60449 1722 aa9.85□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa9.84□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 ENPP3O14638 875 aa9.84□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 STARD3NLO95772 234 aa9.84□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 RFC4P35249 363 aa9.84□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 SMTNP53814 917 aa9.84□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 RIPK4P57078 832 aa9.84□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 DCTN1Q14203 1278 aa9.84□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 C11orf91Q3C1V1 193 aa9.84□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 ATCAYQ86WG3 371 aa9.84□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 RASGRP4Q8TDF6 673 aa9.84□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 SYT17Q9BSW7 474 aa9.84□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 ETNK1Q9HBU6 452 aa9.84□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 ADAMTS8Q9UP79 889 aa9.84□□□□□ -0.83
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM181BA6NEQ2 426 aa9.83□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 CDK2AP1O14519 115 aa9.83□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 SPINT1O43278 529 aa9.83□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 ANP32CO43423 234 aa9.83□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 CRKLP46109 303 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 SMIM5Q71RC9 77 aa9.83□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 EDEM1Q92611 657 aa9.83□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 RUNDC1Q96C34 613 aa9.83□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 GPRASP2Q96D09 838 aa9.83□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 SEC16BQ96JE7 1060 aa9.83□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 FMNL2Q96PY5 1086 aa9.83□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa9.83□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 KCNQ3O43525 872 aa9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 TMPOP42166 694 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 SERINC3Q13530 473 aa9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 C12orf49Q9H741 205 aa9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa9.82□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 SCN11AQ9UI33 1791 aa9.81□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 RAB15P59190 212 aa9.81□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 RELBQ01201 579 aa9.81□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 PAK2Q13177 524 aa9.81□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP9.81□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 AMIGO3Q86WK7 504 aa9.81□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.81□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 MIS18AQ9NYP9 233 aa9.81□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 PPME1Q9Y570 386 aa9.81□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A087WZG4 1122 aa9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms