RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589969.1

NFIC-209, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

TSL 3

Gene NFIC, Length 614 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-209ENST00000589969 TRIM47Q96LD4 638 aa25.24■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 SRRDQ9UH36 339 aa25.24■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 CYP2C8P10632 490 aa25.23■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 DOCK1Q14185 1865 aa25.22■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 FAM196BA6NMK8 535 aa25.22■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 CAP2P40123 477 aa25.22■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 FCGRTP55899 365 aa25.22■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa25.22■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa25.22■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.22■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa25.21■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 ZNF280CQ8ND82 737 aa25.21■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.21■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 MAST2Q6P0Q8 1798 aa25.21■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 FLT1P17948 1338 aa25.2■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 OSBPP22059 807 aa25.2■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 CTGFP29279 349 aa25.2■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 ADGRA1Q86SQ6 560 aa25.2■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 AACSQ86V21 672 aa25.2■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 PNMA3Q9UL41 463 aa25.2■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 USP17L5A8MUK1 530 aa25.19■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 HMMRO75330 724 aa25.19■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 EN2P19622 333 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 CYP7A1P22680 504 aa25.19■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 SPP2Q13103 211 aa25.19■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa25.19■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 RAET1EQ8TD07 263 aa25.19■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 SH3TC2Q8TF17 1288 aa25.19■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 TRIM34Q9BYJ4 488 aa25.19■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 AS3MTQ9HBK9 375 aa25.19■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 MYPNQ86TC9 1320 aa25.18■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 MAP3K12Q12852 859 aa25.18■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.18■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 GINM1Q9NU53 330 aa25.18■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 ASNSP08243 561 aa25.17■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.17■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 BRCA2P51587 3418 aa25.16■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 HLA-DOAP06340 250 aa25.16■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 GRK4P32298 578 aa25.16■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.16■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 WDR18Q9BV38 432 aa25.16■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 PHIPQ8WWQ0 1821 aa25.16■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 SLC34A2O95436 690 aa25.15■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 SH3D19Q5HYK7 790 aa25.15■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 MAGEB6Q8N7X4 407 aa25.15■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.15■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 PALD1Q9ULE6 856 aa25.15■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 COG6Q9Y2V7 657 aa25.15■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa25.14■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 TREML2Q5T2D2 321 aa25.14■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.14■■□□□ 1.62
NFIC-209ENST00000589969 PTPRFP10586 1907 aa25.14■■□□□ 1.61
NFIC-209ENST00000589969 RAB11FIP3O75154 756 aa25.13■■□□□ 1.61
NFIC-209ENST00000589969 MYCP01106 439 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
NFIC-209ENST00000589969 HMGCS2P54868 508 aa25.13■■□□□ 1.61
NFIC-209ENST00000589969 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
NFIC-209ENST00000589969 PRKCZQ05513 592 aa25.13■■□□□ 1.61
NFIC-209ENST00000589969 MIGA1Q8NAN2 632 aa25.13■■□□□ 1.61
NFIC-209ENST00000589969 SLAIN1Q8ND83 568 aa25.13■■□□□ 1.61
NFIC-209ENST00000589969 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
NFIC-209ENST00000589969 USP5P45974 858 aa25.12■■□□□ 1.61
NFIC-209ENST00000589969 FAM110CQ1W6H9 321 aa25.12■■□□□ 1.61
NFIC-209ENST00000589969 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
NFIC-209ENST00000589969 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.12■■□□□ 1.61
NFIC-209ENST00000589969 DNAJC18Q9H819 358 aa25.12■■□□□ 1.61
NFIC-209ENST00000589969 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
NFIC-209ENST00000589969 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
NFIC-209ENST00000589969 BACE1P56817 501 aa25.11■■□□□ 1.61
NFIC-209ENST00000589969 UBXN2AP68543 259 aa25.11■■□□□ 1.61
NFIC-209ENST00000589969 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa25.11■■□□□ 1.61
NFIC-209ENST00000589969 NKX2-3Q8TAU0 364 aa25.11■■□□□ 1.61
NFIC-209ENST00000589969 TMOD4Q9NZQ9 345 aa25.11■■□□□ 1.61
NFIC-209ENST00000589969 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
NFIC-209ENST00000589969 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.11■■□□□ 1.61
NFIC-209ENST00000589969 C19orf81C9J6K1 198 aa25.1■■□□□ 1.61
NFIC-209ENST00000589969 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.1■■□□□ 1.61
NFIC-209ENST00000589969 COA7Q96BR5 231 aa25.1■■□□□ 1.61
NFIC-209ENST00000589969 GCC1Q96CN9 775 aa25.1■■□□□ 1.61
NFIC-209ENST00000589969 FLT3LGP49771 235 aa25.09■■□□□ 1.61
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