RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579859.1

TSPOAP1-AS1-204, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,791 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MYH15Q9Y2K3 1946 aa30.88■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RIMBP2O15034 1052 aa30.87■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP30.87■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NTRK3Q16288 839 aa30.87■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 OLFM4Q6UX06 510 aa30.87■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP30.87■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TNKSO95271 1327 aa30.87■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 USP5P45974 858 aa30.87■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GUCY1B3Q02153 619 aa30.87■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 STYK1Q6J9G0 422 aa30.87■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa30.87■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MCM9Q9NXL9 1143 aa30.87■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa30.86■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SPATA32Q96LK8 384 aa30.86■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 H0YIN7 160 aa30.85■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CYP2D6P10635 497 aa30.85■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLF2Q8IX21 1173 aa30.85■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CFAP45Q9UL16 551 aa30.85■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa30.84■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PRDM1O75626 825 aa30.84■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EVX2Q03828 476 aa30.84■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 BTDP43251 543 aa30.84■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GTF2IP78347 998 aa30.84■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IQCA1Q86XH1 822 aa30.84■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF654Q8IZM8 581 aa30.84■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 USP17L8P0C7I0 530 aa30.83■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IARSP41252 1262 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PDE4BQ07343 736 aa30.83■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C12orf60Q5U649 245 aa30.83■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ATL3Q6DD88 541 aa30.83■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DLEC1Q9Y238 1755 aa30.83■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 STK36Q9NRP7 1315 aa30.83■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NAV1Q8NEY1 1877 aa30.83■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SYCE3A1L190 88 aa30.82■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RTN1Q16799 776 aa30.82■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa30.82■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GAKO14976 1311 aa30.82■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PHKBQ93100 1093 aa30.82■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EYA3Q99504 573 aa30.82■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ALG1Q9BT22 464 aa30.82■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa30.81■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PLCG2P16885 1265 aa30.81■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IFNAR1P17181 557 aa30.81■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NT5C2P49902 561 aa30.81■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa30.81■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LRSAM1Q6UWE0 723 aa30.81■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ROBO3Q96MS0 1386 aa30.81■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CCDC183Q5T5S1 534 aa30.8■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 AMOTL1Q8IY63 956 aa30.8■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa30.8■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ECM29Q5VYK3 1845 aa30.8■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa30.8■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TPRNQ4KMQ1 711 aa30.79■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PPP2R5BQ15173 497 aa30.79■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FANCBQ8NB91 859 aa30.79■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 POLD1P28340 1107 aa30.77■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NUP133Q8WUM0 1156 aa30.77■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CNKSR1Q969H4 720 aa30.77■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GJB4Q9NTQ9 266 aa30.77■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLX4Q8IY92 1834 aa30.77■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DOK7Q18PE1 504 aa30.77■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 BRAPQ7Z569 592 aa30.77■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 AIFM3Q96NN9 605 aa30.77■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLC26A6Q9BXS9 759 aa30.77■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CHRNA5P30532 468 aa30.76■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RHBDL3P58872 404 aa30.76■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa30.76■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TEX11Q8IYF3 940 aa30.76■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 WASF1Q92558 559 aa30.76■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RCOR1Q9UKL0 485 aa30.76■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa30.75■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CATIPQ7Z7H3 387 aa30.75■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FBXW7Q969H0 707 aa30.75■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 USP28Q96RU2 1077 aa30.75■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 G3V3G9 751 aa30.74■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa30.74■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAM47AQ5JRC9 791 aa30.74■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DCAF8Q5TAQ9 597 aa30.74■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TRIM22Q8IYM9 498 aa30.74■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CERS5Q8N5B7 392 aa30.74■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa30.74■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TSPY2A6NKD2 308 aa30.74■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KRT40Q6A162 431 aa30.74■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NBPF11Q86T75 865 aa30.74■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PGBD1Q96JS3 809 aa30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms