RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 SEC23AQ15436 765 aa26.8■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 ESR2Q92731 530 aa26.8■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 SETDB2Q96T68 719 aa26.8■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.8■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 NHSQ6T4R5 1651 aa26.8■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa26.8■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 SEMA3EO15041 775 aa26.8■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 MMP1P03956 469 aa26.8■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 KLRK1P26718 216 aa26.8■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 TIGD1Q96MW7 591 aa26.8■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 NLRP3Q96P20 1036 aa26.8■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 HPSEQ9Y251 543 aa26.8■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 SHC4Q6S5L8 630 aa26.79■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 NOSTRINQ8IVI9 506 aa26.79■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 FANCBQ8NB91 859 aa26.79■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 MYH6P13533 1939 aa26.79■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 TNKSO95271 1327 aa26.79■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa26.78■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 GNPATO15228 680 aa26.78■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 DEXIO95424 95 aa26.78■■□□□ 1.88
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EHD4-202ENST00000569223 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 DPCR1Q3MIW9 517 aa26.78■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 NUP133Q8WUM0 1156 aa26.78■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 BPIFA3Q9BQP9 254 aa26.78■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 SYKP43405 635 aa26.78■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.88
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EHD4-202ENST00000569223 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.77■■□□□ 1.88
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EHD4-202ENST00000569223 BTBD18B2RXH4 712 aa26.77■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 ZPR1O75312 459 aa26.77■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 NLRP12P59046 1061 aa26.77■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 RESP18Q5W5W9 173 aa26.77■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 KCNJ14Q9UNX9 436 aa26.77■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa26.77■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 CUTAO60888 179 aa26.77■■□□□ 1.88
EHD4-202ENST00000569223 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
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EHD4-202ENST00000569223 MAST2Q6P0Q8 1798 aa26.76■■□□□ 1.87
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EHD4-202ENST00000569223 ANKRD2Q9GZV1 360 aa26.76■■□□□ 1.87
EHD4-202ENST00000569223 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.76■■□□□ 1.87
EHD4-202ENST00000569223 LAMB1P07942 1786 aa26.75■■□□□ 1.87
EHD4-202ENST00000569223 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.75■■□□□ 1.87
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EHD4-202ENST00000569223 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
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EHD4-202ENST00000569223 CTR9Q6PD62 1173 aa26.73■■□□□ 1.87
EHD4-202ENST00000569223 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.73■■□□□ 1.87
EHD4-202ENST00000569223 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
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EHD4-202ENST00000569223 AMIGO3Q86WK7 504 aa26.73■■□□□ 1.87
EHD4-202ENST00000569223 MYRIPQ8NFW9 859 aa26.73■■□□□ 1.87
EHD4-202ENST00000569223 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
EHD4-202ENST00000569223 DYNC1I1O14576 645 aa26.72■■□□□ 1.87
EHD4-202ENST00000569223 PCP11498 1178 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
EHD4-202ENST00000569223 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
EHD4-202ENST00000569223 TUBE1Q9UJT0 475 aa26.72■■□□□ 1.87
EHD4-202ENST00000569223 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa26.72■■□□□ 1.87
EHD4-202ENST00000569223 LY75O60449 1722 aa26.72■■□□□ 1.87
EHD4-202ENST00000569223 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
EHD4-202ENST00000569223 TM4SF1P30408 202 aa26.71■■□□□ 1.87
EHD4-202ENST00000569223 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
EHD4-202ENST00000569223 PRDM1O75626 825 aa26.7■■□□□ 1.87
EHD4-202ENST00000569223 RILPL1Q5EBL4 403 aa26.7■■□□□ 1.87
EHD4-202ENST00000569223 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
EHD4-202ENST00000569223 USP17L12C9JPN9 530 aa26.7■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 USP17L21D6R901 530 aa26.7■■□□□ 1.86
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EHD4-202ENST00000569223 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 RRP9O43818 475 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 CATIPQ7Z7H3 387 aa26.69■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 LRRC8AQ8IWT6 810 aa26.69■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 OXER1Q8TDS5 423 aa26.69■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
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EHD4-202ENST00000569223 KCNH3Q9ULD8 1083 aa26.69■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.68■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 PRDX5P30044 214 aa26.68■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 FUT2Q10981 343 aa26.68■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 FAM182BQ5T319 152 aa26.68■■□□□ 1.86
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