RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 GINM1Q9NU53 330 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 SRRDQ9UH36 339 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 ZAP70P43403 619 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 MOGSQ13724 837 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 USP17L5A8MUK1 530 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 IDH1O75874 414 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 CAP2P40123 477 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 AACSQ86V21 672 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 TRIM47Q96LD4 638 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 ASNSP08243 561 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 CYP2C8P10632 490 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 CYP7A1P22680 504 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 ADGRA2Q96PE1 1338 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 POTEFA5A3E0 1075 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 BCRP11274 1271 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 OSBPP22059 807 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 NKX2-3Q8TAU0 364 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 FLT1P17948 1338 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 MYPNQ86TC9 1320 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 RAB11FIP3O75154 756 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 USP5P45974 858 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 UBXN2AP68543 259 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 SPP2Q13103 211 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 GCC1Q96CN9 775 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 GRK4P32298 578 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 CAP1Q01518 475 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 DOCK1Q14185 1865 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 FAM196BA6NMK8 535 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 CAPN2P17655 700 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 TTC6Q86TZ1 520 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 COA7Q96BR5 231 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 C19orf81C9J6K1 198 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 WDR18Q9BV38 432 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 COG6Q9Y2V7 657 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 HMGCS2P54868 508 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 ADGRA1Q86SQ6 560 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 PALD1Q9ULE6 856 aa20.17■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 BACE1P56817 501 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 PDE3AQ14432 1141 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 HTTP42858 3142 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 USP17L10C9JJH3 530 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 MYCP01106 439 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 SLURP2P0DP57 97 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 PRKCZQ05513 592 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 EHD4Q9H223 541 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SPNS1-211ENST00000568829 APBB1O00213 710 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-211ENST00000568829 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-211ENST00000568829 TREML2Q5T2D2 321 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-211ENST00000568829 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-211ENST00000568829 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SPNS1-211ENST00000568829 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS1-211ENST00000568829 CTGFP29279 349 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS1-211ENST00000568829 IRF5Q13568 498 aa20.13■□□□□ 0.81
SPNS1-211ENST00000568829 MTMR2Q13614 643 aa20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms