RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568586.5

RAB40C-211, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB40C, Length 648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-211ENST00000568586 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
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RAB40C-211ENST00000568586 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa35.71■■■■□ 3.31
RAB40C-211ENST00000568586 DOCK1Q14185 1865 aa35.71■■■■□ 3.31
RAB40C-211ENST00000568586 FAM196BA6NMK8 535 aa35.7■■■■□ 3.31
RAB40C-211ENST00000568586 GOLIM4O00461 696 aa35.7■■■■□ 3.31
RAB40C-211ENST00000568586 HAUS7Q99871 368 aa35.7■■■■□ 3.31
RAB40C-211ENST00000568586 HPS5Q9UPZ3 1129 aa35.7■■■■□ 3.31
RAB40C-211ENST00000568586 HTTP42858 3142 aa35.7■■■■□ 3.3
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RAB40C-211ENST00000568586 GPAT2Q6NUI2 795 aa35.69■■■■□ 3.3
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RAB40C-211ENST00000568586 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
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RAB40C-211ENST00000568586 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa35.67■■■■□ 3.3
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RAB40C-211ENST00000568586 CD99L2Q8TCZ2 262 aa35.67■■■■□ 3.3
RAB40C-211ENST00000568586 BOLA2Q9H3K6 86 aa35.67■■■■□ 3.3
RAB40C-211ENST00000568586 DNAJC18Q9H819 358 aa35.67■■■■□ 3.3
RAB40C-211ENST00000568586 PAG1Q9NWQ8 432 aa35.67■■■■□ 3.3
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RAB40C-211ENST00000568586 TBC1D2Q9BYX2 928 aa35.66■■■■□ 3.3
RAB40C-211ENST00000568586 TRIM17Q9Y577 477 aa35.66■■■■□ 3.3
RAB40C-211ENST00000568586 ADGRA2Q96PE1 1338 aa35.65■■■■□ 3.3
RAB40C-211ENST00000568586 C17orf99Q6UX52 265 aa35.65■■■■□ 3.3
RAB40C-211ENST00000568586 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
RAB40C-211ENST00000568586 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa35.64■■■■□ 3.3
RAB40C-211ENST00000568586 ZNF532Q9HCE3 1301 aa35.63■■■■□ 3.29
RAB40C-211ENST00000568586 BCL11AQ9H165 835 aa35.63■■■■□ 3.29
RAB40C-211ENST00000568586 EFCC1Q9HA90 598 aa35.63■■■■□ 3.29
RAB40C-211ENST00000568586 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
RAB40C-211ENST00000568586 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa35.62■■■■□ 3.29
RAB40C-211ENST00000568586 USP5P45974 858 aa35.62■■■■□ 3.29
RAB40C-211ENST00000568586 ECHDC1Q9NTX5 307 aa35.62■■■■□ 3.29
RAB40C-211ENST00000568586 GINM1Q9NU53 330 aa35.62■■■■□ 3.29
RAB40C-211ENST00000568586 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
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RAB40C-211ENST00000568586 EHD4Q9H223 541 aa35.61■■■■□ 3.29
RAB40C-211ENST00000568586 PTPRFP10586 1907 aa35.61■■■■□ 3.29
RAB40C-211ENST00000568586 ADD2P35612 726 aa35.6■■■■□ 3.29
RAB40C-211ENST00000568586 ARHGEF6Q15052 776 aa35.6■■■■□ 3.29
RAB40C-211ENST00000568586 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
RAB40C-211ENST00000568586 ZNF280CQ8ND82 737 aa35.6■■■■□ 3.29
RAB40C-211ENST00000568586 PTPN22Q9Y2R2 807 aa35.6■■■■□ 3.29
RAB40C-211ENST00000568586 TRIM75PA6NK02 468 aa35.59■■■■□ 3.29
RAB40C-211ENST00000568586 USP17L5A8MUK1 530 aa35.59■■■■□ 3.29
RAB40C-211ENST00000568586 ASNSP08243 561 aa35.59■■■■□ 3.29
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RAB40C-211ENST00000568586 TATDN1Q6P1N9 297 aa35.57■■■■□ 3.28
RAB40C-211ENST00000568586 TTC6Q86TZ1 520 aa35.57■■■■□ 3.28
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RAB40C-211ENST00000568586 SH3D19Q5HYK7 790 aa35.56■■■■□ 3.28
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RAB40C-211ENST00000568586 SLFNL1Q499Z3 407 aa35.5■■■■□ 3.27
RAB40C-211ENST00000568586 TAOK2Q9UL54 1235 aa35.5■■■■□ 3.27
RAB40C-211ENST00000568586 LOC285556D6RIA3 1793 aa35.49■■■■□ 3.27
RAB40C-211ENST00000568586 BACE1P56817 501 aa35.49■■■■□ 3.27
RAB40C-211ENST00000568586 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
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