RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 SIPA1L1O43166 1804 aa25.6■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 POTEFA5A3E0 1075 aa25.59■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 CYP2C8P10632 490 aa25.59■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 PPP4CP60510 307 aa25.59■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 NBPF11Q86T75 865 aa25.59■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa25.59■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.59■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.59■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.59■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 HTTP42858 3142 aa25.59■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 APBB1O00213 710 aa25.58■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 CYP7A1P22680 504 aa25.58■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 PSMC4P43686 418 aa25.58■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 BCL11AQ9H165 835 aa25.58■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 PI4KBQ9UBF8 816 aa25.58■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.58■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 ADGRA2Q96PE1 1338 aa25.58■■□□□ 1.69
PPP4C-211ENST00000567642 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 GNRH1P01148 92 aa25.57■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.57■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM106CQ9BVX2 250 aa25.57■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 IGSF3O75054 1194 aa25.56■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 HMMRO75330 724 aa25.56■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 FLT1P17948 1338 aa25.56■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 MYCP01106 439 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 CTGFP29279 349 aa25.55■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 CAP2P40123 477 aa25.55■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 PRMT2P55345 433 aa25.55■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 MAGEB6Q8N7X4 407 aa25.55■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF333Q96JL9 665 aa25.55■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 TRIM47Q96LD4 638 aa25.55■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 TRIM34Q9BYJ4 488 aa25.55■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 CENPFP49454 3210 aa25.54■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 HOXD10P28358 340 aa25.54■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 SPP2Q13103 211 aa25.54■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 SH3TC2Q8TF17 1288 aa25.54■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.54■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.54■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 BCRP11274 1271 aa25.53■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 MAP3K12Q12852 859 aa25.53■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa25.53■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 MIGA1Q8NAN2 632 aa25.53■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.53■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 SRRDQ9UH36 339 aa25.53■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 PALD1Q9ULE6 856 aa25.53■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa25.53■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 LOC285556D6RIA3 1793 aa25.53■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 USP17L5A8MUK1 530 aa25.52■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 EN2P19622 333 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 OSBPP22059 807 aa25.52■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF280CQ8ND82 737 aa25.52■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa25.52■■□□□ 1.68
PPP4C-211ENST00000567642 USP5P45974 858 aa25.51■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 FCGRTP55899 365 aa25.51■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.51■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 RAET1EQ8TD07 263 aa25.51■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.51■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 AS3MTQ9HBK9 375 aa25.51■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 MYPNQ86TC9 1320 aa25.51■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 HLA-DOAP06340 250 aa25.5■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 TREML2Q5T2D2 321 aa25.5■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 HMGCS2P54868 508 aa25.49■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 PNMA3Q9UL41 463 aa25.49■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 DOCK3Q8IZD9 2030 aa25.48■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 CERS3Q8IU89 383 aa25.48■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 DNAJC18Q9H819 358 aa25.48■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 RAB11FIP3O75154 756 aa25.47■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 GDF11O95390 407 aa25.47■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 ASNSP08243 561 aa25.47■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.47■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa25.47■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 NAV1Q8NEY1 1877 aa25.47■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 PRKCZQ05513 592 aa25.46■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.673e-14■□□□□ 8.1
PPP4C-211ENST00000567642 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PPP4C-211ENST00000567642 GRK4P32298 578 aa25.45■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 JAG1P78504 1218 aa25.45■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 GABRQQ9UN88 632 aa25.45■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 GOLIM4O00461 696 aa25.44■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 MTMR2Q13614 643 aa25.44■■□□□ 1.66
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