RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567377.5

COMMD4-218, Transcript of COMM domain containing 4, humanhuman

TSL 3

Gene COMMD4, Length 461 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD4-218ENST00000567377 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
COMMD4-218ENST00000567377 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.04■■□□□ 1.12
COMMD4-218ENST00000567377 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.04■■□□□ 1.12
COMMD4-218ENST00000567377 DCTPP1Q9H773 170 aa22.04■■□□□ 1.12
COMMD4-218ENST00000567377 EFCC1Q9HA90 598 aa22.04■■□□□ 1.12
COMMD4-218ENST00000567377 PDHXO00330 501 aa22.03■■□□□ 1.12
COMMD4-218ENST00000567377 GNRH1P01148 92 aa22.03■■□□□ 1.12
COMMD4-218ENST00000567377 CAP2P40123 477 aa22.03■■□□□ 1.12
COMMD4-218ENST00000567377 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.03■■□□□ 1.12
COMMD4-218ENST00000567377 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.03■■□□□ 1.12
COMMD4-218ENST00000567377 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
COMMD4-218ENST00000567377 USP5P45974 858 aa22.02■■□□□ 1.12
COMMD4-218ENST00000567377 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
COMMD4-218ENST00000567377 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
COMMD4-218ENST00000567377 MOGSQ13724 837 aa22.02■■□□□ 1.12
COMMD4-218ENST00000567377 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
COMMD4-218ENST00000567377 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.02■■□□□ 1.12
COMMD4-218ENST00000567377 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
COMMD4-218ENST00000567377 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
COMMD4-218ENST00000567377 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.02■■□□□ 1.12
COMMD4-218ENST00000567377 GOLIM4O00461 696 aa22.01■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.01■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.01■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 USP17L5A8MUK1 530 aa22■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 ASNSP08243 561 aa22■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 PDE6AP16499 860 aa22■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 C17orf99Q6UX52 265 aa22■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 TTC6Q86TZ1 520 aa22■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 HAUS7Q99871 368 aa22■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 AS3MTQ9HBK9 375 aa22■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 PALD1Q9ULE6 856 aa22■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 DOCK1Q14185 1865 aa22■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 GPAT2Q6NUI2 795 aa21.99■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF280CQ8ND82 737 aa21.99■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 GPATCH3Q96I76 525 aa21.99■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 EHD4Q9H223 541 aa21.99■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 BOLA2Q9H3K6 86 aa21.99■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.99■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 FOCADQ5VW36 1801 aa21.99■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 TRIM75PA6NK02 468 aa21.98■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 FAM196BA6NMK8 535 aa21.98■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 PRMT2P55345 433 aa21.98■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 AAMPQ13685 434 aa21.98■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.98■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 BCL11AQ9H165 835 aa21.98■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 SLURP2P0DP57 97 aa21.97■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 GADL1Q6ZQY3 521 aa21.97■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 WDR18Q9BV38 432 aa21.97■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 ECHDC1Q9NTX5 307 aa21.97■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.97■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 SPP2Q13103 211 aa21.96■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 SERPINB13Q9UIV8 391 aa21.96■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 PNMA3Q9UL41 463 aa21.96■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa21.96■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa21.96■■□□□ 1.11
COMMD4-218ENST00000567377 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.95■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 HOXD10P28358 340 aa21.95■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 UBE3CQ15386 1083 aa21.95■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 SH3D19Q5HYK7 790 aa21.95■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 ADGRA2Q96PE1 1338 aa21.95■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 C19orf81C9J6K1 198 aa21.94■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 ADD2P35612 726 aa21.94■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 TATDN1Q6P1N9 297 aa21.94■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 NBPF11Q86T75 865 aa21.94■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 DNAJC18Q9H819 358 aa21.94■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 CPA4Q9UI42 421 aa21.94■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.94■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 PHIPQ8WWQ0 1821 aa21.93■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa21.93■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 MYH1P12882 1939 aa21.92■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 CYP2C8P10632 490 aa21.92■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 BCRP11274 1271 aa21.92■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 BACE1P56817 501 aa21.92■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 ARMC5Q96C12 935 aa21.92■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 PTPRFP10586 1907 aa21.92■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 PSMC4P43686 418 aa21.91■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 TMOD4Q9NZQ9 345 aa21.91■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa21.91■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 SIPA1L1O43166 1804 aa21.9■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 TTC41PQ6P2S7 1318 aa21.9■■□□□ 1.1
COMMD4-218ENST00000567377 USP17L10C9JJH3 530 aa21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms