RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		21.16	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	BTBD18	B2RXH4	712 aa		21.16	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	PRKAB2	O43741	272 aa		21.16	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	21.16	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	ISM2	Q6H9L7	571 aa		21.16	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	21.16	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		21.16	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		21.15	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	PTPRE	P23469	700 aa		21.15	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	FANCB	Q8NB91	859 aa		21.15	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	ERO1A	Q96HE7	468 aa		21.15	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	DACH1	Q9UI36	760 aa		21.15	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		21.15	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		21.15	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		21.15	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	21.14	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	KANK3	Q6NY19	840 aa		21.14	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		21.14	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	21.14	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		21.14	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	SNAP23	O00161	211 aa		21.14	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	CAMTA2	O94983	1202 aa		21.14	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	ATP1A3	P13637	1013 aa		21.14	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	PPARA	Q07869	468 aa		21.14	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		21.14	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		21.14	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	ESR2	Q92731	530 aa		21.14	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	XBP1	P17861	261 aa		21.13	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	GUCY1A2	P33402	732 aa		21.13	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	ATP6V1A	P38606	617 aa		21.13	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	21.13	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	21.13	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	CHRND	Q07001	517 aa		21.13	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	CFAP100	Q494V2	611 aa		21.13	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	21.13	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	21.13	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		21.13	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	NTSR2	O95665	410 aa		21.13	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		21.13	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	MLKL	Q8NB16	471 aa		21.13	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		21.13	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	21.13	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		21.12	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	21.12	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	CYP7A1	P22680	504 aa		21.12	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	POSTN	Q15063	836 aa		21.12	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	21.12	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	VSTM4	Q8IW00	320 aa		21.12	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		21.12	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		21.12	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	21.12	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		21.12	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	21.12	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		21.11	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	LAMB2	P55268	1798 aa		21.11	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	21.11	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		21.11	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	21.11	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		21.11	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	PHLPP1	O60346	1717 aa		21.11	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	CBX1	P83916	185 aa		21.11	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		21.1	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		21.1	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		21.1	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	21.1	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	21.1	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	SIK1	P57059	783 aa		21.1	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		21.1	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		21.1	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		21.1	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	FANCL	Q9NW38	375 aa		21.1	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	OGFR	Q9NZT2	677 aa		21.1	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	21.1	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	SMARCE1	Q969G3	411 aa		21.1	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	TMX1	Q9H3N1	280 aa		21.1	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	RREB1	Q92766	1687 aa		21.1	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	21.09	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	SEC23A	Q15436	765 aa		21.09	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	TNKS	O95271	1327 aa		21.09	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	21.08	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	UBE4A	Q14139	1066 aa		21.08	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	DDB1	Q16531	1140 aa		21.08	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	21.08	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		21.08	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	21.08	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	RAI14	Q9P0K7	980 aa		21.08	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		21.08	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		21.08	■□□□□ 0.97
RRN3-205	ENST00000563559	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		21.08	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	BMP15	O95972	392 aa		21.08	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	21.08	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	DPF2	Q92785	391 aa		21.08	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	ABCF2	Q9UG63	623 aa		21.08	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		21.08	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	BMP6	P22004	513 aa		21.07	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	NR5A1	Q13285	461 aa		21.07	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		21.07	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	21.07	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	21.07	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	21.07	■□□□□ 0.96

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