RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-210ENST00000561408 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TMOD3-210ENST00000561408 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 M0R082 166 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 WEE1P30291 646 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 ADH7P40394 386 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 DDR1Q08345 913 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 TRAPPC3LQ5T215 181 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 IER5Q5VY09 327 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 CNTROBQ8N137 903 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 VTI1AQ96AJ9 217 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 KLK14Q9P0G3 267 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 ALBP02768 609 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 SIK1P57059 783 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 CD163Q86VB7 1156 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 USHBP1Q8N6Y0 703 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 PIGBQ92521 554 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 IGFLR1Q9H665 355 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 SCN11AQ9UI33 1791 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 ECE1P42892 770 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 CHRNA4P43681 627 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 CIAPIN1Q6FI81 312 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 DCAF11Q8TEB1 546 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 PNMA5Q96PV4 448 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 GSX2Q9BZM3 304 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 BRCA2P51587 3418 aa6.5□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 TRAF5O00463 557 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 EPB42P16452 691 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 RFC4P35249 363 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 IDH3AP50213 366 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 CCINQ13939 588 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 CST9Q5W186 159 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 EFCC1Q9HA90 598 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 ASAP1Q9ULH1 1129 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 AKAP11Q9UKA4 1901 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 MON2Q7Z3U7 1717 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 ADAM23O75077 832 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 FBLN1P23142 703 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 EPHX2P34913 555 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 MAP2K2P36507 400 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 NME9Q86XW9 330 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 TTLL6Q8N841 843 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.372e-9■■■■■ 223.6
TMOD3-210ENST00000561408 CENPFP49454 3210 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 CEP290O15078 2479 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 CYP27B1O15528 508 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 CA12O43570 354 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 MICAL2O94851 1124 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 FURINP09958 794 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 NFKB1P19838 968 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 INPP5BP32019 993 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 ARSDP51689 593 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 MYO19Q96H55 970 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 PRIMPOLQ96LW4 560 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 ZMYND15Q9H091 742 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 SLX4Q8IY92 1834 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 RNF123Q5XPI4 1314 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 TTC21AQ8NDW8 1320 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
TMOD3-210ENST00000561408 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 FAM229AH3BQW9 127 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 PRMT3O60678 531 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 LILRB5O75023 590 aa6.46□□□□□ -1.38
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