RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558960.1

ADAMTS17-205, Transcript of ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17, humanhuman

TSL 2

Gene ADAMTS17, Length 571 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAMTS17-205ENST00000558960 LCORLQ8N3X6 602 aa25.29■■□□□ 1.64
ADAMTS17-205ENST00000558960 APPBP2Q92624 585 aa25.29■■□□□ 1.64
ADAMTS17-205ENST00000558960 PICK1Q9NRD5 415 aa25.29■■□□□ 1.64
ADAMTS17-205ENST00000558960 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
ADAMTS17-205ENST00000558960 GTF2A2P52657 109 aa25.28■■□□□ 1.64
ADAMTS17-205ENST00000558960 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.28■■□□□ 1.64
ADAMTS17-205ENST00000558960 SAGE1Q9NXZ1 904 aa25.28■■□□□ 1.64
ADAMTS17-205ENST00000558960 FOXN1O15353 648 aa25.27■■□□□ 1.64
ADAMTS17-205ENST00000558960 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
ADAMTS17-205ENST00000558960 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.27■■□□□ 1.64
ADAMTS17-205ENST00000558960 AMOTL1Q8IY63 956 aa25.27■■□□□ 1.64
ADAMTS17-205ENST00000558960 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.27■■□□□ 1.64
ADAMTS17-205ENST00000558960 OTUD5Q96G74 571 aa25.27■■□□□ 1.64
ADAMTS17-205ENST00000558960 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
ADAMTS17-205ENST00000558960 ALDH1A1P00352 501 aa25.26■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 PPIL2Q13356 520 aa25.26■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.26■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 MCM9Q9NXL9 1143 aa25.26■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 MYH7P12883 1935 aa25.25■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.25■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 GNAT2P19087 354 aa25.25■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 SDR42E1Q8WUS8 393 aa25.25■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 EHD4Q9H223 541 aa25.25■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 RNF186Q9NXI6 227 aa25.25■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa25.25■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 FOCADQ5VW36 1801 aa25.25■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 GJA5P36382 358 aa25.24■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 GINM1Q9NU53 330 aa25.24■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 SERPINB13Q9UIV8 391 aa25.24■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 TAOK2Q9UL54 1235 aa25.24■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 OTOFQ9HC10 1997 aa25.24■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 TRPA1O75762 1119 aa25.23■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 CHGBP05060 677 aa25.23■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 CETPP11597 493 aa25.23■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 CAP2P40123 477 aa25.23■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 SNAPC2Q13487 334 aa25.23■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.23■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 OSBP2Q969R2 916 aa25.23■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.23■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa25.23■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 RILPL2Q969X0 211 aa25.22■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 FAM196BA6NMK8 535 aa25.21■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 CXCL11O14625 94 aa25.21■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 IRF6O14896 467 aa25.21■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 PRKAB2O43741 272 aa25.21■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 PTPRAP18433 802 aa25.21■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.21■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 GIMAP6Q6P9H5 292 aa25.21■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 IFNL1Q8IU54 200 aa25.21■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.21■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.21■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.21■■□□□ 1.63
ADAMTS17-205ENST00000558960 MYH1P12882 1939 aa25.2■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa25.2■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 GPAA1O43292 621 aa25.2■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 SLURP2P0DP57 97 aa25.2■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 CCL15Q16663 113 aa25.2■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa25.2■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 ASNSP08243 561 aa25.19■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 PLCD1P51178 756 aa25.19■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 LBX1P52954 281 aa25.19■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 HELLSQ9NRZ9 838 aa25.19■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 KCNH4Q9UQ05 1017 aa25.19■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 NACAP1Q9BZK3 213 aa25.18■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 AS3MTQ9HBK9 375 aa25.18■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 SWAP70Q9UH65 585 aa25.18■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 USP17L5A8MUK1 530 aa25.17■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 M0R2C6 588 aa25.17■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 APPP05067 770 aa25.17■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 TATDN1Q6P1N9 297 aa25.17■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 CFHR5Q9BXR6 569 aa25.17■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 DNAJC18Q9H819 358 aa25.17■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.17■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 USP17L12C9JPN9 530 aa25.16■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 USP17L21D6R901 530 aa25.16■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 HIP1O00291 1037 aa25.16■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 PDE4AP27815 886 aa25.16■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 C12orf60Q5U649 245 aa25.16■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 BRI3BPQ8WY22 251 aa25.16■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 CABP5Q9NP86 173 aa25.16■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 TSKSQ9UJT2 592 aa25.16■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 GSG1L2A8MUP6 293 aa25.15■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 GABPAQ06546 454 aa25.15■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 SBK1Q52WX2 424 aa25.15■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.15■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
ADAMTS17-205ENST00000558960 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms