RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.27■■□□□ 1.64
TMOD3-203ENST00000558455 LAMB1P07942 1786 aa25.26■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 SIPA1L1O43166 1804 aa25.26■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 MYH7P12883 1935 aa25.26■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 INHBEP58166 350 aa25.26■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.26■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.26■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 IRF6O14896 467 aa25.25■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 HLA-DOAP06340 250 aa25.25■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 PPATQ06203 517 aa25.25■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 PPIL2Q13356 520 aa25.25■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 IFNL1Q8IU54 200 aa25.25■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 GTF2A2P52657 109 aa25.24■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 SDR42E1Q8WUS8 393 aa25.24■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 DNAJC18Q9H819 358 aa25.24■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 PICK1Q9NRD5 415 aa25.24■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 BRI3BPQ8WY22 251 aa25.23■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 FSD1Q9BTV5 496 aa25.23■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa25.22■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 PRKAB2O43741 272 aa25.22■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 PTPRAP18433 802 aa25.22■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 SNAPC2Q13487 334 aa25.22■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 CCL15Q16663 113 aa25.22■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 APPBP2Q92624 585 aa25.22■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 PTPN18Q99952 460 aa25.22■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 TRIM34Q9BYJ4 488 aa25.22■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 OSBP2Q969R2 916 aa25.21■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 MCM9Q9NXL9 1143 aa25.21■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 MYH1P12882 1939 aa25.21■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 DOCK1Q14185 1865 aa25.21■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 NAV1Q8NEY1 1877 aa25.21■■□□□ 1.63
TMOD3-203ENST00000558455 TBC1D8O95759 1140 aa25.2■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 ALDH1A1P00352 501 aa25.2■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 CETPP11597 493 aa25.2■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 TTC6Q86TZ1 520 aa25.2■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 EHD4Q9H223 541 aa25.2■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 KCNH4Q9UQ05 1017 aa25.2■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 CAP2P40123 477 aa25.19■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.19■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa25.19■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 SERPINB13Q9UIV8 391 aa25.19■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.19■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 PLCD1P51178 756 aa25.18■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.18■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 EVI5LQ96CN4 794 aa25.18■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 CFHR5Q9BXR6 569 aa25.18■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa25.18■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 EVX2Q03828 476 aa25.17■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa25.17■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 M0R2C6 588 aa25.16■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 CYP2D6P10635 497 aa25.16■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.16■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 OSBPL3Q9H4L5 887 aa25.16■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.16■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 CXCL11O14625 94 aa25.15■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 GPAA1O43292 621 aa25.15■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 GDF11O95390 407 aa25.15■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 JAG1P78504 1218 aa25.15■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 BTBD19C9JJ37 291 aa25.14■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 MOGSQ13724 837 aa25.14■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.14■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 TATDN1Q6P1N9 297 aa25.14■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 DDRGK1Q96HY6 314 aa25.14■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
TMOD3-203ENST00000558455 TRIM75PA6NK02 468 aa25.13■■□□□ 1.61
TMOD3-203ENST00000558455 ASNSP08243 561 aa25.13■■□□□ 1.61
TMOD3-203ENST00000558455 GABPAQ06546 454 aa25.13■■□□□ 1.61
TMOD3-203ENST00000558455 CRHR2Q13324 411 aa25.13■■□□□ 1.61
TMOD3-203ENST00000558455 ATAD5Q96QE3 1844 aa25.13■■□□□ 1.61
TMOD3-203ENST00000558455 PHIPQ8WWQ0 1821 aa25.12■■□□□ 1.61
TMOD3-203ENST00000558455 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
TMOD3-203ENST00000558455 USP17L5A8MUK1 530 aa25.12■■□□□ 1.61
TMOD3-203ENST00000558455 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.12■■□□□ 1.61
TMOD3-203ENST00000558455 GPR25O00155 361 aa25.12■■□□□ 1.61
TMOD3-203ENST00000558455 PDE4AP27815 886 aa25.12■■□□□ 1.61
TMOD3-203ENST00000558455 SHMT1P34896 483 aa25.12■■□□□ 1.61
TMOD3-203ENST00000558455 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
TMOD3-203ENST00000558455 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa25.12■■□□□ 1.61
TMOD3-203ENST00000558455 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa25.11■■□□□ 1.61
TMOD3-203ENST00000558455 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms