RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 NOSTRINQ8IVI9 506 aa24.48■■□□□ 1.51
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TMEM260-216ENST00000557657 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
TMEM260-216ENST00000557657 MMP1P03956 469 aa24.47■■□□□ 1.51
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TMEM260-216ENST00000557657 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
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TMEM260-216ENST00000557657 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TMEM260-216ENST00000557657 TIGD1Q96MW7 591 aa24.4■■□□□ 1.5
TMEM260-216ENST00000557657 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
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TMEM260-216ENST00000557657 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.39■■□□□ 1.5
TMEM260-216ENST00000557657 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
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