RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557439.5

XRCC3-218, Transcript of X-ray repair cross complementing 3, humanhuman

TSL 5

Gene XRCC3, Length 2,599 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC3-218ENST00000557439 UBASH3AP57075 661 aa20.4■□□□□ 0.86
XRCC3-218ENST00000557439 CHRNDQ07001 517 aa20.4■□□□□ 0.86
XRCC3-218ENST00000557439 CFAP100Q494V2 611 aa20.4■□□□□ 0.86
XRCC3-218ENST00000557439 SYT10Q6XYQ8 523 aa20.4■□□□□ 0.86
XRCC3-218ENST00000557439 SHISA4Q96DD7 197 aa20.4■□□□□ 0.86
XRCC3-218ENST00000557439 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.86
XRCC3-218ENST00000557439 STRCQ7RTU9 1775 aa20.4■□□□□ 0.86
XRCC3-218ENST00000557439 IFNAR1P17181 557 aa20.4■□□□□ 0.86
XRCC3-218ENST00000557439 TPM4P67936 248 aa20.4■□□□□ 0.86
XRCC3-218ENST00000557439 TIGD1Q96MW7 591 aa20.4■□□□□ 0.86
XRCC3-218ENST00000557439 IMPACTQ9P2X3 320 aa20.4■□□□□ 0.86
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XRCC3-218ENST00000557439 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.34■□□□□ 0.85
XRCC3-218ENST00000557439 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa20.34■□□□□ 0.85
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XRCC3-218ENST00000557439 CSRNP2Q9H175 543 aa20.33■□□□□ 0.85
XRCC3-218ENST00000557439 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa20.33■□□□□ 0.85
XRCC3-218ENST00000557439 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
XRCC3-218ENST00000557439 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
XRCC3-218ENST00000557439 A0A087X0B3 334 aa20.32■□□□□ 0.84
XRCC3-218ENST00000557439 KCNQ2O43526 872 aa20.32■□□□□ 0.84
XRCC3-218ENST00000557439 DEXIO95424 95 aa20.32■□□□□ 0.84
XRCC3-218ENST00000557439 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.32■□□□□ 0.84
XRCC3-218ENST00000557439 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa20.32■□□□□ 0.84
XRCC3-218ENST00000557439 TOP1P11387 765 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
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