RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 APBB1O00213 710 aa26.51■■□□□ 1.83
CIPC-208ENST00000557115 HMMRO75330 724 aa26.51■■□□□ 1.83
CIPC-208ENST00000557115 CYP7A1P22680 504 aa26.51■■□□□ 1.83
CIPC-208ENST00000557115 HOXD10P28358 340 aa26.51■■□□□ 1.83
CIPC-208ENST00000557115 ADGRA1Q86SQ6 560 aa26.51■■□□□ 1.83
CIPC-208ENST00000557115 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa26.51■■□□□ 1.83
CIPC-208ENST00000557115 TRIM34Q9BYJ4 488 aa26.51■■□□□ 1.83
CIPC-208ENST00000557115 BCL11AQ9H165 835 aa26.51■■□□□ 1.83
CIPC-208ENST00000557115 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa26.51■■□□□ 1.83
CIPC-208ENST00000557115 PRMT2P55345 433 aa26.5■■□□□ 1.83
CIPC-208ENST00000557115 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
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CIPC-208ENST00000557115 ADGRA2Q96PE1 1338 aa26.49■■□□□ 1.83
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CIPC-208ENST00000557115 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa26.49■■□□□ 1.83
CIPC-208ENST00000557115 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
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CIPC-208ENST00000557115 ZNF333Q96JL9 665 aa26.49■■□□□ 1.83
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CIPC-208ENST00000557115 FLT1P17948 1338 aa26.48■■□□□ 1.83
CIPC-208ENST00000557115 CAP2P40123 477 aa26.48■■□□□ 1.83
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CIPC-208ENST00000557115 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa26.48■■□□□ 1.83
CIPC-208ENST00000557115 HTTP42858 3142 aa26.48■■□□□ 1.83
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CIPC-208ENST00000557115 SRRDQ9UH36 339 aa26.47■■□□□ 1.83
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CIPC-208ENST00000557115 USP17L5A8MUK1 530 aa26.46■■□□□ 1.83
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CIPC-208ENST00000557115 FCGRTP55899 365 aa26.46■■□□□ 1.83
CIPC-208ENST00000557115 MIGA1Q8NAN2 632 aa26.46■■□□□ 1.83
CIPC-208ENST00000557115 ZNF280CQ8ND82 737 aa26.46■■□□□ 1.83
CIPC-208ENST00000557115 RAET1EQ8TD07 263 aa26.46■■□□□ 1.83
CIPC-208ENST00000557115 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.46■■□□□ 1.83
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CIPC-208ENST00000557115 DOCK1Q14185 1865 aa26.45■■□□□ 1.83
CIPC-208ENST00000557115 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
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CIPC-208ENST00000557115 EN2P19622 333 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
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CIPC-208ENST00000557115 CTGFP29279 349 aa26.45■■□□□ 1.82
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CIPC-208ENST00000557115 CERS3Q8IU89 383 aa26.45■■□□□ 1.82
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CIPC-208ENST00000557115 ANTXR1Q9H6X2 564 aa26.45■■□□□ 1.82
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CIPC-208ENST00000557115 MAST2Q6P0Q8 1798 aa26.44■■□□□ 1.82
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CIPC-208ENST00000557115 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
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CIPC-208ENST00000557115 HMGCS2P54868 508 aa26.42■■□□□ 1.82
CIPC-208ENST00000557115 TREML2Q5T2D2 321 aa26.42■■□□□ 1.82
CIPC-208ENST00000557115 RAB11FIP3O75154 756 aa26.41■■□□□ 1.82
CIPC-208ENST00000557115 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP26.41■■□□□ 1.82
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CIPC-208ENST00000557115 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CIPC-208ENST00000557115 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa26.4■■□□□ 1.82
CIPC-208ENST00000557115 PRKCZQ05513 592 aa26.4■■□□□ 1.82
CIPC-208ENST00000557115 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa26.4■■□□□ 1.82
CIPC-208ENST00000557115 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CIPC-208ENST00000557115 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa26.4■■□□□ 1.82
CIPC-208ENST00000557115 CENPFP49454 3210 aa26.39■■□□□ 1.82
CIPC-208ENST00000557115 GDF11O95390 407 aa26.39■■□□□ 1.82
CIPC-208ENST00000557115 GRK4P32298 578 aa26.39■■□□□ 1.82
CIPC-208ENST00000557115 TMOD4Q9NZQ9 345 aa26.39■■□□□ 1.82
CIPC-208ENST00000557115 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 DNAJC18Q9H819 358 aa26.38■■□□□ 1.81
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CIPC-208ENST00000557115 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
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CIPC-208ENST00000557115 PDE3AQ14432 1141 aa26.37■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa26.37■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 WDR18Q9BV38 432 aa26.37■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 GINM1Q9NU53 330 aa26.37■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 GOLIM4O00461 696 aa26.36■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 SH3D19Q5HYK7 790 aa26.36■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.36■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 TTC6Q86TZ1 520 aa26.36■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP26.36■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 GABRQQ9UN88 632 aa26.36■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 PHIPQ8WWQ0 1821 aa26.36■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 BACE1P56817 501 aa26.35■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
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