RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553961.1

ACTN1-AS1-202, ACTN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene ACTN1-AS1, Length 599 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PNMA3Q9UL41 463 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MYH2Q9UKX2 1941 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 APBB1O00213 710 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 USP5P45974 858 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FCGRTP55899 365 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP16.68■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RAET1EQ8TD07 263 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KIF1BPQ96EK5 621 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 AS3MTQ9HBK9 375 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 COG6Q9Y2V7 657 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa16.68■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FAM196BA6NMK8 535 aa16.67■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CYP2C8P10632 490 aa16.67■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa16.67■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZNF280CQ8ND82 737 aa16.67■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa16.67■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LAMB1P07942 1786 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MYCP01106 439 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CAP2P40123 477 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SPP2Q13103 211 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GPAT2Q6NUI2 795 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MAGEB6Q8N7X4 407 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RHPN1Q8TCX5 695 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 USP17L5A8MUK1 530 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RAB11FIP3O75154 756 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ASNSP08243 561 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 OSBPP22059 807 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MOGSQ13724 837 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MIGA1Q8NAN2 632 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZNF333Q96JL9 665 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SRRDQ9UH36 339 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FLT1P17948 1338 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SLURP2P0DP57 97 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TRIM47Q96LD4 638 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TMOD4Q9NZQ9 345 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PALD1Q9ULE6 856 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MYPNQ86TC9 1320 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 POTEFA5A3E0 1075 aa16.63■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ADGRA1Q86SQ6 560 aa16.63■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SH3TC2Q8TF17 1288 aa16.63■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GINM1Q9NU53 330 aa16.63■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DOCK2Q92608 1830 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 BCRP11274 1271 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 HMGCS2P54868 508 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CAP1Q01518 475 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PDE3AQ14432 1141 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TTC6Q86TZ1 520 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 COA7Q96BR5 231 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 HTTP42858 3142 aa16.62■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 EN2P19622 333 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GRK4P32298 578 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 UBXN2AP68543 259 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ADGRA2Q96PE1 1338 aa16.61■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GOLIM4O00461 696 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TREML2Q5T2D2 321 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 WDR18Q9BV38 432 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP16.6■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ANTXR1Q9H6X2 564 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SERPINB13Q9UIV8 391 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CENPFP49454 3210 aa16.6■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 C19orf81C9J6K1 198 aa16.59■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 USP17L10C9JJH3 530 aa16.59■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PRKCZQ05513 592 aa16.59■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MTMR2Q13614 643 aa16.59■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SLAIN1Q8ND83 568 aa16.59■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NKX2-3Q8TAU0 364 aa16.59■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP16.59■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FEZ1Q99689 392 aa16.59■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CABP5Q9NP86 173 aa16.59■□□□□ 0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TAOK2Q9UL54 1235 aa16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms