RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553948.1

TTC7B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, humanhuman

TSL 5

Gene TTC7B, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TTC7B-202ENST00000553948 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa39.4■■■■□ 3.9
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TTC7B-202ENST00000553948 PALD1Q9ULE6 856 aa39.33■■■■□ 3.89
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TTC7B-202ENST00000553948 BCL11AQ9H165 835 aa39.31■■■■□ 3.88
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TTC7B-202ENST00000553948 USP17L5A8MUK1 530 aa39.29■■■■□ 3.88
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TTC7B-202ENST00000553948 HOXD10P28358 340 aa39.26■■■■□ 3.88
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TTC7B-202ENST00000553948 LOC285556D6RIA3 1793 aa39.23■■■■□ 3.87
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TTC7B-202ENST00000553948 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP39.19■■■■□ 3.86
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TTC7B-202ENST00000553948 RAET1EQ8TD07 263 aa39.19■■■■□ 3.86
TTC7B-202ENST00000553948 LRRCC1Q9C099 1032 aa39.18■■■■□ 3.86
TTC7B-202ENST00000553948 TTC6Q86TZ1 520 aa39.17■■■■□ 3.86
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