RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 UBE4AQ14139 1066 aa9.52□□□□□ -0.89
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PTPRB-208ENST00000550358 MMRN2Q9H8L6 949 aa9.52□□□□□ -0.89
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PTPRB-208ENST00000550358 MAP7Q14244 749 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRB-208ENST00000550358 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
PTPRB-208ENST00000550358 TSHZ3Q63HK5 1081 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRB-208ENST00000550358 NOP56O00567 594 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRB-208ENST00000550358 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRB-208ENST00000550358 TRAPPC10P48553 1259 aa9.49□□□□□ -0.89
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