RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546652.6

PCBP2-208, Transcript of poly(rC) binding protein 2, human

TSL 5

Gene PCBP2, Length 823 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCBP2-208	ENST00000546652	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PCBP2-208	ENST00000546652		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PCBP2-208	ENST00000546652	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PCBP2-208	ENST00000546652	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PCBP2-208	ENST00000546652	PPP4C	P60510	307 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PCBP2-208	ENST00000546652	MAP3K12	Q12852	859 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PCBP2-208	ENST00000546652	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PCBP2-208	ENST00000546652	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PCBP2-208	ENST00000546652	C17orf99	Q6UX52	265 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PCBP2-208	ENST00000546652	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PCBP2-208	ENST00000546652	NBPF11	Q86T75	865 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PCBP2-208	ENST00000546652	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PCBP2-208	ENST00000546652	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PCBP2-208	ENST00000546652	PALD1	Q9ULE6	856 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PCBP2-208	ENST00000546652	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PCBP2-208	ENST00000546652	IGSF3	O75054	1194 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	HLA-DOA	P06340	250 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	PSMC4	P43686	418 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	USP5	P45974	858 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	SPP2	Q13103	211 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	MOGS	Q13724	837 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	FLT1	P17948	1338 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	RAB11FIP3	O75154	756 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	HOXD10	P28358	340 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	CAP2	P40123	477 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	LAMB1	P07942	1786 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	DOCK2	Q92608	1830 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	USP17L5	A8MUK1	530 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	GNRH1	P01148	92 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	PDE3A	Q14432	1141 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	CERS3	Q8IU89	383 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	POTEF	A5A3E0	1075 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	GOLIM4	O00461	696 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	HMGCS2	P54868	508 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	RAET1E	Q8TD07	263 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	ARMC5	Q96C12	935 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	TRIM47	Q96LD4	638 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	GDF11	O95390	407 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	ASNS	P08243	561 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	OSBP	P22059	807 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	PRMT2	P55345	433 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	FCGRT	P55899	365 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	TREML2	Q5T2D2	321 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	SRRD	Q9UH36	339 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	PNMA3	Q9UL41	463 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	BCR	P11274	1271 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	CTGF	P29279	349 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	13.9	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	ZNF333	Q96JL9	665 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PCBP2-208	ENST00000546652	MYPN	Q86TC9	1320 aa		13.9	□□□□□ -0.19
PCBP2-208	ENST00000546652	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PCBP2-208	ENST00000546652	PDE6A	P16499	860 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PCBP2-208	ENST00000546652	MTMR2	Q13614	643 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PCBP2-208	ENST00000546652	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PCBP2-208	ENST00000546652	TTC6	Q86TZ1	520 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PCBP2-208	ENST00000546652	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PCBP2-208	ENST00000546652	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PCBP2-208	ENST00000546652	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19
PCBP2-208	ENST00000546652	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PCBP2-208	ENST00000546652	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PCBP2-208	ENST00000546652	DNAJC18	Q9H819	358 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PCBP2-208	ENST00000546652	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PCBP2-208	ENST00000546652	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PCBP2-208	ENST00000546652	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PCBP2-208	ENST00000546652	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PCBP2-208	ENST00000546652	JAG1	P78504	1218 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PCBP2-208	ENST00000546652	PRKCZ	Q05513	592 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PCBP2-208	ENST00000546652	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PCBP2-208	ENST00000546652	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PCBP2-208	ENST00000546652	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PCBP2-208	ENST00000546652	DOCK1	Q14185	1865 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PCBP2-208	ENST00000546652	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PCBP2-208	ENST00000546652	USP17L10	C9JJH3	530 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PCBP2-208	ENST00000546652	GH2	P01242	217 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PCBP2-208	ENST00000546652	ATP5J	P18859	108 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PCBP2-208	ENST00000546652	GRK4	P32298	578 aa		13.87	□□□□□ -0.19

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