RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536283.1

ARF3-205, Transcript of ADP ribosylation factor 3, humanhuman

TSL 4

Gene ARF3, Length 537 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3-205ENST00000536283 GADL1Q6ZQY3 521 aa27.07■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa27.07■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa27.07■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa27.07■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 SIPA1L1O43166 1804 aa27.06■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 TRIM75PA6NK02 468 aa27.06■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 CYP7A1P22680 504 aa27.06■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 FLT1P17948 1338 aa27.06■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 CYP2C8P10632 490 aa27.05■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 ARMC5Q96C12 935 aa27.05■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 PI4KBQ9UBF8 816 aa27.05■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 SIRT2Q8IXJ6 389 aa27.04■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 KIF1BPQ96EK5 621 aa27.04■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 ANTXR1Q9H6X2 564 aa27.04■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa27.03■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 MAGEB6Q8N7X4 407 aa27.03■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 GNRH1P01148 92 aa27.02■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 CAP2P40123 477 aa27.02■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 MAP3K12Q12852 859 aa27.02■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 MIGA1Q8NAN2 632 aa27.02■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 BCL11AQ9H165 835 aa27.02■■□□□ 1.92
ARF3-205ENST00000536283 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 C20orf194Q5TEA3 1177 aa27.01■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 TRIM34Q9BYJ4 488 aa27.01■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa27.01■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 POTEFA5A3E0 1075 aa27■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 CTGFP29279 349 aa27■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 PSMC4P43686 418 aa27■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 PALD1Q9ULE6 856 aa27■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 RAB11FIP3O75154 756 aa26.99■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 BCRP11274 1271 aa26.99■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 PRMT2P55345 433 aa26.99■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 PDE3AQ14432 1141 aa26.99■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 NBPF11Q86T75 865 aa26.99■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 CERS3Q8IU89 383 aa26.99■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 ZNF280CQ8ND82 737 aa26.99■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 ZNF333Q96JL9 665 aa26.99■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 TRIM47Q96LD4 638 aa26.99■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 TBC1D2Q9BYX2 928 aa26.99■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa26.99■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 LOC285556D6RIA3 1793 aa26.99■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 USP17L5A8MUK1 530 aa26.98■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 HLA-DOAP06340 250 aa26.98■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 SPP2Q13103 211 aa26.98■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa26.98■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 DNAJC18Q9H819 358 aa26.98■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 HTTP42858 3142 aa26.97■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 USP5P45974 858 aa26.97■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 AS3MTQ9HBK9 375 aa26.97■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 MYH1P12882 1939 aa26.96■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 OSBPP22059 807 aa26.96■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 HOXD10P28358 340 aa26.96■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 TREML2Q5T2D2 321 aa26.96■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 SH3TC2Q8TF17 1288 aa26.96■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP26.96■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 SRRDQ9UH36 339 aa26.96■■□□□ 1.91
ARF3-205ENST00000536283 HMGCS2P54868 508 aa26.95■■□□□ 1.9
ARF3-205ENST00000536283 FCGRTP55899 365 aa26.95■■□□□ 1.9
ARF3-205ENST00000536283 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
ARF3-205ENST00000536283 TMEM106CQ9BVX2 250 aa26.95■■□□□ 1.9
ARF3-205ENST00000536283 PNMA3Q9UL41 463 aa26.95■■□□□ 1.9
ARF3-205ENST00000536283 MGAMO43451 1857 aa26.95■■□□□ 1.9
ARF3-205ENST00000536283 MYPNQ86TC9 1320 aa26.94■■□□□ 1.9
ARF3-205ENST00000536283 GDF11O95390 407 aa26.94■■□□□ 1.9
ARF3-205ENST00000536283 MYCP01106 439 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
ARF3-205ENST00000536283 ASNSP08243 561 aa26.94■■□□□ 1.9
ARF3-205ENST00000536283 GOLIM4O00461 696 aa26.93■■□□□ 1.9
ARF3-205ENST00000536283 RAET1EQ8TD07 263 aa26.93■■□□□ 1.9
ARF3-205ENST00000536283 PDE6AP16499 860 aa26.92■■□□□ 1.9
ARF3-205ENST00000536283 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa26.92■■□□□ 1.9
ARF3-205ENST00000536283 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
ARF3-205ENST00000536283 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa26.91■■□□□ 1.9
ARF3-205ENST00000536283 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa26.91■■□□□ 1.9
ARF3-205ENST00000536283 EN2P19622 333 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
ARF3-205ENST00000536283 JAG1P78504 1218 aa26.91■■□□□ 1.9
ARF3-205ENST00000536283 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP26.91■■□□□ 1.92e-24■□□□□ 10.8
ARF3-205ENST00000536283 MTMR2Q13614 643 aa26.91■■□□□ 1.9
ARF3-205ENST00000536283 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
ARF3-205ENST00000536283 SH3D19Q5HYK7 790 aa26.91■■□□□ 1.9
ARF3-205ENST00000536283 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
ARF3-205ENST00000536283 WDR18Q9BV38 432 aa26.91■■□□□ 1.9
ARF3-205ENST00000536283 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms