RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 EVI5LQ96CN4 794 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM196BA6NMK8 535 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 HLA-DOAP06340 250 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 ERO1BQ86YB8 467 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 FOXN1O15353 648 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 SREBF2Q12772 1141 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 OTUD5Q96G74 571 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.89■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 OSBP2Q969R2 916 aa22.89■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 CA12O43570 354 aa22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 PRKAB2O43741 272 aa22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 PDE4AP27815 886 aa22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 TM4SF4P48230 202 aa22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 TTC6Q86TZ1 520 aa22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 DNAJC18Q9H819 358 aa22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 NEFLP07196 543 aa22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 PPATQ06203 517 aa22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 PPIL2Q13356 520 aa22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 EHD4Q9H223 541 aa22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 M0R2C6 588 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 GPAA1O43292 621 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 INHBEP58166 350 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 TICAM2Q86XR7 235 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 IRF6O14896 467 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 PICK1Q9NRD5 415 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 CAP2P40123 477 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 PLCD1P51178 756 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 GTF2A2P52657 109 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 RILPL2Q969X0 211 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 RNF186Q9NXI6 227 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 PTPRAP18433 802 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 GNAT2P19087 354 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-208ENST00000531226 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.83■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 TRPA1O75762 1119 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 SNAPC2Q13487 334 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 IFNL1Q8IU54 200 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 TSKSQ9UJT2 592 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 CYP2D6P10635 497 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 EVX2Q03828 476 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 GABPAQ06546 454 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 CCL15Q16663 113 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 ALDH1A1P00352 501 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 CETPP11597 493 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 LBX1P52954 281 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 TTC22Q5TAA0 569 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 GINM1Q9NU53 330 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 USP17L12C9JPN9 530 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 USP17L21D6R901 530 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 GDF11O95390 407 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 ASNSP08243 561 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 C12orf60Q5U649 245 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 PTPN18Q99952 460 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-208ENST00000531226 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
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