RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
PACSIN3-204ENST00000528201 MAGEB6Q8N7X4 407 aa29.21■■■□□ 2.27
PACSIN3-204ENST00000528201 MIGA1Q8NAN2 632 aa29.21■■■□□ 2.27
PACSIN3-204ENST00000528201 CPA4Q9UI42 421 aa29.21■■■□□ 2.27
PACSIN3-204ENST00000528201 BCL11AQ9H165 835 aa29.2■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 DNAJC18Q9H819 358 aa29.2■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 TRIM75PA6NK02 468 aa29.19■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 RAB11FIP3O75154 756 aa29.18■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 CYP2C8P10632 490 aa29.18■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 CTGFP29279 349 aa29.18■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 PI4KBQ9UBF8 816 aa29.18■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 PALD1Q9ULE6 856 aa29.18■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 JAG1P78504 1218 aa29.17■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 CAP2P40123 477 aa29.16■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 MAP3K12Q12852 859 aa29.16■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa29.16■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 SIPA1L1O43166 1804 aa29.15■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 DOCK1Q14185 1865 aa29.15■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa29.15■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 GADL1Q6ZQY3 521 aa29.15■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP29.14■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 ARMC5Q96C12 935 aa29.14■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa29.14■■■□□ 2.26
PACSIN3-204ENST00000528201 BRCA2P51587 3418 aa29.13■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 GOLIM4O00461 696 aa29.13■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 BCRP11274 1271 aa29.13■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 SPP2Q13103 211 aa29.13■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 PDE6AP16499 860 aa29.12■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 TREML2Q5T2D2 321 aa29.12■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 TRIM47Q96LD4 638 aa29.12■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 PHIPQ8WWQ0 1821 aa29.12■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF280CQ8ND82 737 aa29.11■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 POTEFA5A3E0 1075 aa29.1■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 ARHGEF6Q15052 776 aa29.1■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa29.1■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 BOLA2Q9H3K6 86 aa29.1■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa29.1■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa29.1■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa29.09■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 PSMC4P43686 418 aa29.09■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 KIF22Q14807 665 aa29.09■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 SLFNL1Q499Z3 407 aa29.09■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa29.08■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 USP17L5A8MUK1 530 aa29.08■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 GDF11O95390 407 aa29.08■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 ATP5JP18859 108 aa29.08■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 USP5P45974 858 aa29.08■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF333Q96JL9 665 aa29.08■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 LRRCC1Q9C099 1032 aa29.08■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF532Q9HCE3 1301 aa29.08■■■□□ 2.25
PACSIN3-204ENST00000528201 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 HMGCS2P54868 508 aa29.07■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 CERS3Q8IU89 383 aa29.07■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 FOCADQ5VW36 1801 aa29.06■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 CHGBP05060 677 aa29.06■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 HLA-DOAP06340 250 aa29.06■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 HAUS7Q99871 368 aa29.06■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 PAG1Q9NWQ8 432 aa29.06■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 PTPRFP10586 1907 aa29.06■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa29.05■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 OSBPP22059 807 aa29.05■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 EVX2Q03828 476 aa29.05■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 SH3TC2Q8TF17 1288 aa29.05■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 WDR18Q9BV38 432 aa29.05■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 TBC1D2Q9BYX2 928 aa29.05■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa29.05■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 GNRH1P01148 92 aa29.04■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 ASNSP08243 561 aa29.04■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa29.04■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 SH3D19Q5HYK7 790 aa29.04■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 TRIM34Q9BYJ4 488 aa29.04■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 SRRDQ9UH36 339 aa29.04■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa29.04■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 PLCD1P51178 756 aa29.03■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 MTMR2Q13614 643 aa29.03■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 LCORLQ8N3X6 602 aa29.03■■■□□ 2.24
PACSIN3-204ENST00000528201 DCTPP1Q9H773 170 aa29.03■■■□□ 2.24
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