RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527412.1

PRMT1-208, Transcript of protein arginine methyltransferase 1, human

TSL 3

Gene PRMT1, Length 463 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT1-208	ENST00000527412	MEIS3	Q99687	375 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	CPA4	Q9UI42	421 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	DOCK2	Q92608	1830 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	ERC2	O15083	957 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	ATP2B3	Q16720	1220 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	VPS37D	Q86XT2	251 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	FAM151A	Q8WW52	585 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	LPIN2	Q92539	896 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	CSAD	Q9Y600	493 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	SIPA1L1	O43166	1804 aa		10	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	AK9	Q5TCS8	1911 aa		10	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	TNNI2	P48788	182 aa		10	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	ANAPC15	P60006	121 aa		10	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	RASGRF1	Q13972	1273 aa		10	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		10	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	PI16	Q6UXB8	463 aa		10	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		10	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	GAK	O14976	1311 aa		10	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	MGAM	O43451	1857 aa		10	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	CIAO1	O76071	339 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	CYP2C8	P10632	490 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	BCR	P11274	1271 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	CETP	P11597	493 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	SLC5A1	P13866	664 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	OSBP	P22059	807 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	9.99	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	TIMM10	P62072	90 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	MAP3K10	Q02779	954 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	PPAT	Q06203	517 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	SNAPC2	Q13487	334 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	CCDC102B	Q68D86	513 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	KIF2C	Q99661	725 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	COPRS	Q9NQ92	184 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	FAM196B	A6NMK8	535 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	PDHX	O00330	501 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	RHBDL3	P58872	404 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	EVX2	Q03828	476 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	IDI2	Q9BXS1	227 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	USP26	Q9BXU7	913 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	USP40	Q9NVE5	1235 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	GABRQ	Q9UN88	632 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	DOCK1	Q14185	1865 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	ALPK3	Q96L96	1907 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	RAB11FIP3	O75154	756 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	JAG1	P78504	1218 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	TFCP2	Q12800	502 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	SRRD	Q9UH36	339 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	MAST3	O60307	1309 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412	LAMA3	Q16787	3333 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PRMT1-208	ENST00000527412		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
PRMT1-208	ENST00000527412	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PRMT1-208	ENST00000527412		H0YGN5	161 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PRMT1-208	ENST00000527412	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
PRMT1-208	ENST00000527412	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	9.96	□□□□□ -0.82	2e-7	■□□□□ 9.2
PRMT1-208	ENST00000527412	PTPRA	P18433	802 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PRMT1-208	ENST00000527412	SDS	P20132	328 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PRMT1-208	ENST00000527412	PSMC4	P43686	418 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PRMT1-208	ENST00000527412	PRKCZ	Q05513	592 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PRMT1-208	ENST00000527412	DCAF15	Q66K64	600 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PRMT1-208	ENST00000527412	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
PRMT1-208	ENST00000527412	IL17RA	Q96F46	866 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PRMT1-208	ENST00000527412	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
PRMT1-208	ENST00000527412	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PRMT1-208	ENST00000527412	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PRMT1-208	ENST00000527412	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PRMT1-208	ENST00000527412	PLXNB2	O15031	1838 aa		9.96	□□□□□ -0.82

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