RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524131.5

MEG3-223, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 5 BASIC

Gene MEG3, Length 721 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-223	ENST00000524131	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		14	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	VPS37D	Q86XT2	251 aa		14	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	TRIM47	Q96LD4	638 aa		14	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	FGFR2	P21802	821 aa		13.99	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	BCAM	P50895	628 aa		13.99	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	MOGS	Q13724	837 aa		13.99	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		13.99	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	METTL24	Q5JXM2	366 aa		13.99	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		13.99	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		13.99	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		13.99	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	HOOK2	Q96ED9	719 aa		13.99	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		13.99	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	SRRD	Q9UH36	339 aa		13.99	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		13.99	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		13.99	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	OSBP	P22059	807 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	DCAF15	Q66K64	600 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	SNRK	Q9NRH2	765 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	CPA4	Q9UI42	421 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		13.98	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	PLXNB2	O15031	1838 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	SGSM2	O43147	1006 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	PSMC4	P43686	418 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	HSCB	Q8IWL3	235 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	HAUS7	Q99871	368 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	PRO3102	Q9H379	93 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		13.97	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131		A0A0C4DFX4	3053 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	MYPN	Q86TC9	1320 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	PDHX	O00330	501 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	GRK4	P32298	578 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	GJA8	P48165	433 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	FAM151A	Q8WW52	585 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	KIF2C	Q99661	725 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		13.96	□□□□□ -0.17
MEG3-223	ENST00000524131		A0A1B0GUL7	405 aa		13.95	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	BCR	P11274	1271 aa		13.95	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	NFIA	Q12857	509 aa		13.95	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		13.95	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		13.95	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		13.95	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	SIPA1L1	O43166	1804 aa		13.94	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	MYH7	P12883	1935 aa		13.94	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	GJB1	P08034	283 aa		13.94	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	CCL5	P13501	91 aa		13.94	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	PRDX5	P30044	214 aa		13.94	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	PRKCZ	Q05513	592 aa		13.94	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		13.94	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		13.94	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		13.94	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		13.94	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	RAET1E	Q8TD07	263 aa		13.94	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	FSD1	Q9BTV5	496 aa		13.94	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		13.94	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		13.94	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		13.94	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		13.93	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		13.93	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	TCP10	Q12799	353 aa		13.93	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	ATP2B3	Q16720	1220 aa		13.93	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		13.93	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		13.93	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		13.93	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	ST18	O60284	1047 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	CYP2C8	P10632	490 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	HOXD10	P28358	340 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	HSPA4	P34932	840 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	MCM2	P49736	904 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	GABRQ	Q9UN88	632 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		13.92	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18

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