RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	POM121	Q96HA1	1249 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	MYD88	Q99836	296 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	TMX1	Q9H3N1	280 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	MAP10	Q9P2G4	905 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	C5	P01031	1676 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	MAST3	O60307	1309 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	BECN2	A8MW95	431 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	RNF223	E7ERA6	249 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746		H7C1W4	665 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	IKBKB	O14920	756 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	FANCG	O15287	622 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	IGSF3	O75054	1194 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	TADA3	O75528	432 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	CMA1	P23946	247 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ME1	P48163	572 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	BRAP	Q7Z569	592 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF592	Q92610	1267 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	IFNK	Q9P0W0	207 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	HPSE	Q9Y251	543 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	CLIC4	Q9Y696	253 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A1B0GVL5	298 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746		A6NJR5	290 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	KIF28P	B7ZC32	967 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746		M0R2C6	588 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLIM4	O00461	696 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	MYO1B	O43795	1136 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	CIAO1	O76071	339 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	PHKG2	P15735	406 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ABL2	P42684	1182 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ANTXR2	P58335	489 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	GUCY1B3	Q02153	619 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	PSME1	Q06323	249 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC39A6	Q13433	755 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	TMC6	Q7Z403	805 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	PNMA1	Q8ND90	353 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	TIGD1	Q96MW7	591 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	SDF4	Q9BRK5	362 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	CPD	O75976	1380 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	MEGF6	O75095	1541 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	SPTLC2	O15270	562 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF202	O95125	648 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	SMC2	O95347	1197 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	MYL6B	P14649	208 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	PFKFB1	P16118	471 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	PLA2G4A	P47712	749 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	FGD1	P98174	961 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	FANCC	Q00597	558 aa		5.74	□□□□□ -1.49

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