RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-223ENST00000515011 TRIM29Q14134 588 aa26.54■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 STK38Q15208 465 aa26.54■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 CKAP2LQ8IYA6 745 aa26.54■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 PCDHA7Q9UN72 937 aa26.54■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 MRVI1Q9Y6F6 885 aa26.54■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 LRRC37AA6NMS7 1700 aa26.54■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 MYH2Q9UKX2 1941 aa26.54■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 A0A1W2PQ27 194 aa26.54■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 A0A1W2PQ64 194 aa26.54■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 A0A1W2PQD8 194 aa26.54■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 PPP2R5BQ15173 497 aa26.54■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 ADALQ6DHV7 355 aa26.54■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 FANCBQ8NB91 859 aa26.54■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 UFL1O94874 794 aa26.53■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 FAM160A1Q05DH4 1040 aa26.53■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 NBPF11Q86T75 865 aa26.53■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 TRIM22Q8IYM9 498 aa26.53■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 ENGASEQ8NFI3 743 aa26.53■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.53■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.841e-6■■■□□ 16.3
PDE4D-223ENST00000515011 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 ANO1Q5XXA6 986 aa26.53■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.53■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 GGA1Q9UJY5 639 aa26.53■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 CLCN1P35523 988 aa26.52■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 GSTO1P78417 241 aa26.52■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 IQCA1Q86XH1 822 aa26.52■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 FSIP1Q8NA03 581 aa26.52■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 SPTLC2O15270 562 aa26.51■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 CTAGE5O15320 804 aa26.51■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 FAM200AQ8TCP9 573 aa26.51■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.84
PDE4D-223ENST00000515011 PRDM1O75626 825 aa26.51■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 LTBP1Q14766 1721 aa26.51■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 ZSCAN30Q86W11 494 aa26.51■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 NUP133Q8WUM0 1156 aa26.51■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 USP25Q9UHP3 1055 aa26.51■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 UBE2Q2LH0YL09 131 aa26.5■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 DEXIO95424 95 aa26.5■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 CD209Q9NNX6 404 aa26.5■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 IL1R1P14778 569 aa26.5■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.49■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 GUCY1A2P33402 732 aa26.49■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 EVX2Q03828 476 aa26.49■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP26.49■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 EP400Q96L91 3159 aa26.49■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 KINO60870 393 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 CYP2D6P10635 497 aa26.48■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 GRIK5Q16478 980 aa26.48■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 SASS6Q6UVJ0 657 aa26.48■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 TMC4Q7Z404 712 aa26.48■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC39Q9UFE4 941 aa26.48■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.48■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 PLSCR1O15162 318 aa26.48■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 PPP4CP60510 307 aa26.48■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF827Q17R98 1081 aa26.48■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 CATIPQ7Z7H3 387 aa26.48■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 MMP1P03956 469 aa26.47■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 SLC39A14Q15043 492 aa26.47■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 DDAH1O94760 285 aa26.47■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 LDHCP07864 332 aa26.47■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 CALM1P0DP23 149 aa26.47■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 CALM2P0DP24 149 aa26.47■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 CALM3P0DP25 149 aa26.47■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 NT5C2P49902 561 aa26.47■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 TBC1D16Q8TBP0 767 aa26.47■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 AKT1S1Q96B36 256 aa26.47■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 MCM9Q9NXL9 1143 aa26.47■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 BAG3O95817 575 aa26.46■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 PDE4BQ07343 736 aa26.46■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 DIXDC1Q155Q3 683 aa26.46■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 ANO6Q4KMQ2 910 aa26.46■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa26.46■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 ROBO3Q96MS0 1386 aa26.46■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 NAV1Q8NEY1 1877 aa26.45■■□□□ 1.83
PDE4D-223ENST00000515011 ADCY5O95622 1261 aa26.45■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 TROAPQ12815 778 aa26.45■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP26.45■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 C12orf60Q5U649 245 aa26.45■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 CERS3Q8IU89 383 aa26.45■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 POLLQ9UGP5 575 aa26.45■■□□□ 1.82
PDE4D-223ENST00000515011 USP5P45974 858 aa26.44■■□□□ 1.82
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